微山县的水路运输历史较久。史书记载：周敬王三十六年(前484年)，吴王夫差北征，率师过淮河后，即溯泗水而北上。东晋永和八年(352年)和太和四年(369年)，荀羡、桓温北征，亦是率舟师溯泗水而北上的。迨元建都大都后，相继开挖济州河、会通河、通惠河，北京至杭州的大运河，始告全线通航。明清两代，漕粮北运，北货南调，几乎全靠大运河运输。沿湖各县农湖业产品，也由南北各大商贾，通过大运河运至全国各地。
水路客运 微山县的河道客运，始于何时，已无从查考。湖泊客运则始于明初。开始是用小木船渡运过往客商，运客数量无记载。随着湖面的扩大，航线和渡口也逐渐增加，至清末陆续设置过数十条客运航线，百余个渡口，年渡过往行人数千人次。
建国初，仍是私人购船自己渡运。1956年，韩庄港木帆船运输合作社用15只木帆船专营客运，年运客4000～6000人次，周转量162～250万人公里。
1958年7月，县人委将本单位的3只机动船改为客运船，行驶在新开辟的韩庄至济宁顺河门的航线上。人民公社化后，沿湖农村由生产队派人派船渡运。
1961年9月7日，济宁至常口客运航线开航，隔日往返。10月1日，谷亭至白沙客运航线开航。至1974年，全县有常年渡口13处，渡船51只，155吨位，平均日渡585人次。1980年后，个体运输专业户开始用小型机动船渡运行人，不再因为天气风向的影响而停渡。1985年，全县有客运航线30余条，航程300公里，客运船101只(其中汽船4艘，木船15只，余为小机动船)，日均运客2100余人次，年运63万余人次，客运周转量近2000万人公里。
1986年后，随着南四湖的开发建设，来南四湖旅游的客人逐年增多，旅游船随之兴起。1990年，全县有客运航线40余条，客运船300艘，年客运量26.3万人次，客运周转量378万人公里。
水路货运 微山县境内的水路货运，明清两代最为繁盛。永乐九年(1411年)，过境漕船万余艘，运粮400余万石。成化之后，年过境漕船15000余艘，运粮518.7万石。随着漕船的往返过境，韩庄、夏镇、南阳成为沿湖各县的货物集散地，货运量日趋增加。清光绪二十七年，(1901年)，全漕改折，漕运停止。微山县境内的水路货运逐渐减少。1949年，仅有货运木帆船80只，400吨位，航程60公里，运货4.6万吨，货物周转量276万吨公里。
新中国建立后，水路货运事业迅速发展。1953年，全县有货运木帆船120只，航程200公里，货运量8.95万吨，货物周转量1790万吨公里。1956年农渔业合作化后，韩庄、夏镇、沛县先后建立运输社。各农渔业合作社，也陆续建立运输队，集体承担货运任务。60年代初，少数公社用机动帆船运输，全年货运量增至9.40万吨，货物周转量1880万吨公里。70年代，除韩庄、夏镇、两城、留庄建有航运社外，夏镇、昭阳、高楼、彭口闸、微山岛、南阳、两城、鲁桥、侯楼、张楼、欢城11处公社还组织有专业运输队，年运货8万吨左右，货物周转量最多者达2137万吨公里。进入80年代，货运实现了机械化，结束了人工划船的历史。1985年，全县有运货船2004只，31283马力，货运量8.47万吨，货物周转量15152万吨公里。1990年，全县有运货船3650只，34000马力，年货运量80万吨，货物周转量35000万吨公里。
表12-13 1949～1990年水路运输货运量统计表
┌──┬────────────┬──────────────────┐
│年份│船只 │货运量 │
│ ├──┬─────────┼──────┬─────┬─────┤
│ │合计│其中 │内河通航里程│内河货运量│货物周转量│
│ │ ├───┬─────┤(公里) │(万吨) │(万吨公里)│
│ │ │木帆船│机动船 │ │ │ │
│ │ │(只) │(只/马力) │ │ │ │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1949│80 │80 │- │60 │4.60 │276 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1950│85 │85 │- │60 │5.00 │300 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1951│85 │85 │- │120 │10.20 │1224 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1952│90 │90 │- │120 │9.08 │1089.6 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1953│120 │120 │- │200 │8.95 │1790 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1954│123 │123 │- │200 │10.10 │2020 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1955│145 │145 │- │200 │8.30 │1600 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1956│155 │155 │- │200 │7.93 │1584 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1957│159 │159 │- │200 │8.40 │1680 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1958│182 │182 │- │200 │6.90 │1380 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1959│164 │164 │- │200 │7.30 │1460 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1960│174 │174 │- │200 │8.25 │1650 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1961│175 │175 │- │200 │9.40 │1880 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1962│100 │96 │4/240 │200 │7.80 │1560 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1963│158 │157 │1/12 │51.7 │4.98 │257.49 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1964│161 │160 │1/12 │54.6 │5.04 │277.23 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1965│154 │153 │1/12 │50.9 │5.54 │281.76 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1966│152 │153 │1/12 │52.2 │6.02 │314.11 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1967│151 │150 │1/12 │57.4 │5.95 │341.55 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1968│140 │139 │1/12 │57.4 │5.95 │341.55 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1969│105 │103 │2/36 │54.4 │2.74 │149.27 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1970│74 │72 │2/36 │72.8 │13.79 │1003.81 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1971│78 │76 │2/36 │57.2 │8.91 │509.42 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1972│79 │75 │4/84 │87.4 │11.44 │999.40 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1973│86 │75 │11/216 │117.5 │11.81 │1387.64 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1974│68 │55 │13/539 │152.8 │7.37 │1125.59 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1975│70 │55 │15/740 │212.1 │8.79 │1864.21 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1976│75 │42 │33/940 │273.3 │6.68 │1879.71 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1977│94 │34 │60/1815 │363.6 │4.83 │1757.55 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1978│151 │25 │126/3850 │376.4 │5.68 │2137.32 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1979│153 │13 │140/4822 │278.7 │5.28 │1462.88 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1980│259 │- │259/6135 │372.5 │3.68 │1369.23 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1981│685 │- │685/11913 │462.2 │4.89 │2384.81 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1982│1188│1 │1187/17593│487.4 │4.89 │2384.81 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1983│1850│1 │1849/26898│464.4 │5.52 │2562.92 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1984│1463│1 │1462/23478│464.4 │4.44 │4325.70 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1985│2004│- │2004/31283│510 │8.47 │15152 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1986│2803│- │2803/32800│550 │24 │10246 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1987│3100│- │3100/33000│753 │95.6 │20955 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1988│3230│- │3230/33800│500 │55.9 │15836 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1989│3650│- │3650/34000│500 │55.9 │15836 │
├──┼──┼───┼─────┼──────┼─────┼─────┤
│1990│3650│- │3650/34000│500 │80 │35000 │
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