清除苇草 1953年8月，山东省防汛指挥部与济宁专署，共同组织鱼台、嘉祥、凫山3县民工1300人，割除南店子至刘香庄段小黄河(即牛头河)西岸苇草，开辟出一条宽300米，长13.8公里的行洪通道。
1955年6月15日～7月15日，微山县组织民工3500人，割除四里湾上下游，和邢庄缺口上游至大捐以下苇草，开辟一条宽300米的行洪通道，共割除湖苇550亩，湖草11730亩，国家补偿苇、草占青费6.76万元。
1962年6月15日，微山县组织南阳、昭阳公社湖渔民880人，小船293只，割除新万福河口经四里湾缺口至独山湖段苇草，共割除苇6577亩，草2883亩。
1964年6月20日，微山县再次组织两城、鲁桥、留庄、南阳、昭阳、傅村6公社民工3500人，船1800只，分南、北两段，割除苇草。北段从徐庄经四里湾至独山湖明水处，割除宽度300～1600米不等；南段自邢庄至二级坝闸下明水处，割除宽度300～2000米。两段共长35公里，总面积40583亩。其中，苇5100亩，草35483亩。7月20日结工，国家补助21.2万元。
开挖缺口 1953年，开挖四里湾(在南阳东北)1号缺口，长60米，底高程挖至33米，泄南阳湖水入独山湖。
1955年4月15日，济宁专署治淮指挥部，调集鱼台、嘉祥民工1.09万人，开挖四里湾2～4号缺口。2号缺口挖宽140米；3号、4号缺口挖宽200米，底高程均挖至33米，5月23日竣工，完成土方33.7万立方米，用工日22.8万个。
1958年2月，微山县又组织民工开挖四里湾5～8号缺口。5～7号缺口各挖宽200米，8号缺口挖宽125米，底高程均挖至34米。至此，1～8号缺口总宽1325米。
1959年春，微山县调集民工堵闭四里湾2～8号缺口，致使南阳湖水下泄受阻，水位抬高，滨湖地区洪涝灾害随之发生。1962年春，济宁地区水建指挥部调集微山县民工，将堵闭的缺口又全部扒开。
1963年4月10日，微山县组织鲁桥、傅村、南阳、马坡、两城、微山岛6公社3100民工，扩挖四里湾5、6号缺口。5号缺口挖长至650米，6号缺口挖长至900米，底宽均挖至196米。5月22日竣工，完成土方7.3万立方米，用工日7.9万个。
同时，济宁市组织民工7900人，扩挖7、8号缺口。7号缺口底宽扩挖至196米，挖长1100米；8号缺口底宽121米，挖长1750米，底高程一律挖至33米。5月20日竣工，完成土方14.5万立方米，用工日15.3万个。
四里湾缺口的陆续开挖，使独山湖的进水量增加，随有开挖邢庄14道缺口之举。
邢庄缺口，位于漕运新渠南阳至满口段。1955年4月22日，鱼台、嘉祥县民工，于开挖四里湾缺口的同时，拓宽加深邢庄缺口。原设计，凡缺口宽不足100米者，一律挖至100米，底高程33米。后因水位抬高，水下施工困难，改变原设计。缺口底高程提高0.2米，缺口宽一般挖至150～200米，最宽者450米。沿新渠70米外弃土，弃土宽20米。5月11日结工，完成土方5.3万立方米，用工日6.3万个。
切除沙滩 安口沙滩，位于二级坝一、二闸闸下5公里处。此沙滩是老薛河、古 水洪积物形成的噘嘴浅滩，高于湖底0.8米，不仅束窄了湖面，而且影响行洪。
1955年5～7月，微山县出民工3500人，首先拆除安口、大捐的捕鱼埝。
1965年4月11日，济宁专署调集嘉祥、金乡县民工4000人，切除安口沙滩，长1500米，底宽400米。30日竣工，完成土方15.67万立方米，用工日10.14万个，国家投资13.37万元。
小卫河以东沙滩。1964年春，微山县调集微山岛、夏镇、傅村、欢城、留庄、两城、鲁桥、马坡等9公社5300民工，切除小卫河以东沙滩，长2400米。堆土宽70米，每隔200米留一50米宽的缺口行洪，完成土方14.3万立方米，用工日15万个。
大卜湾沙滩，位于安口沙滩东，是安口滩地的上游，亦由老薛河、古 水的洪积物堆积而成。
1972年12月，微山县调集傅村、欢城公社3000民工，切除大卜湾沙滩，并结合修筑前、后邵集庄台。1973年2月竣工，完成土方13.3万立方米，用工日15.9万个，国家投资15.3万元。
拆除旧堤坝 1963年4月10日，微山县民工在扩挖四里湾5、6号缺口的同时，组织韩庄、夏镇1100民工，拆除二级坝上下游围埝353米，捕鱼埝123.5米。5月20日结工，完成土方2.1万立方米，用工日3.1万个。7月上旬～8月底，又组织民工200人，配合挖泥船拆除水下部分，完成土方2万立方米，用工日1.2万个。
1963年4月10日，济宁市也组织民工340人，拆除新万福河口李堂桥村南、村西旧堤600米，村西北捕鱼埝300米。5月20日结工，完成土方9200立方米，用工日9500个。
开挖二级坝闸上、下引河 闸上引河。1975年，山东省治淮南四湖流域工程指挥部疏浚队开挖。引河分两股：
一股从水围子村北京杭运河起，东南行通一闸，长3.8公里，宽度由50米渐变至300米，河底高程30.5米；一股通三闸，长3.2公里，宽500米，河底高程30.5米。中间分岔至二闸，岔长1.2公里，底宽330米，河底高程31米。设计完成土方462万立方米。1979年停工，仅完成土方203万立方米，国家投资348万元。
闸下引河。1971年7月～1983年，水电部十三工程局第一分局开挖。引河分东西两股：
东股，上游又分两股，分别自第一、二节制闸开始，行3公里汇合后，穿过大卜湾以东高滩(即安口噘嘴之上段)，经沙谷堆村西，大捐村东，至薪薛河入湖口，转向南。两股共长26.9公里，宽300～320米，底高程30米，完成土方2500万立方米，国家投资3724万元。
西股，原设计分为3段：自第三节 制闸之下向西南，与湖腰扩大深槽相接，长3.95公里为上段；向下至沿河口，长9.35公里，为中段；沿河口以下，沿湖西航道，至鹿口河口再转东南，为下段，长12.5公里。上下段，尚未施工。中段，1978年11月，济宁专署调集金乡、鱼台民工1.5万人，开始修筑排泥区围埝。1979年3月，水电部十三工程局第一分局出动16艘80立方米/时绞吸式挖泥船开挖，1983年基本竣工。河长8.58公里，宽300米，河底高程30米，完成土方890万立方米，国家投资1682万元。
第三节 疏浚湖底
清除苇草 1953年8月，山东省防汛指挥部与济宁专署，共同组织鱼台、嘉祥、凫山3县民工1300人，割除南店子至刘香庄段小黄河(即牛头河)西岸苇草，开辟出一条宽300米，长13.8公里的行洪通道。
1955年6月15日～7月15日，微山县组织民工3500人，割除四里湾上下游，和邢庄缺口上游至大捐以下苇草，开辟一条宽300米的行洪通道，共割除湖苇550亩，湖草11730亩，国家补偿苇、草占青费6.76万元。
1962年6月15日，微山县组织南阳、昭阳公社湖渔民880人，小船293只，割除新万福河口经四里湾缺口至独山湖段苇草，共割除苇6577亩，草2883亩。
1964年6月20日，微山县再次组织两城、鲁桥、留庄、南阳、昭阳、傅村6公社民工3500人，船1800只，分南、北两段，割除苇草。北段从徐庄经四里湾至独山湖明水处，割除宽度300～1600米不等；南段自邢庄至二级坝闸下明水处，割除宽度300～2000米。两段共长35公里，总面积40583亩。其中，苇5100亩，草35483亩。7月20日结工，国家补助21.2万元。
开挖缺口 1953年，开挖四里湾(在南阳东北)1号缺口，长60米，底高程挖至33米，泄南阳湖水入独山湖。
1955年4月15日，济宁专署治淮指挥部，调集鱼台、嘉祥民工1.09万人，开挖四里湾2～4号缺口。2号缺口挖宽140米；3号、4号缺口挖宽200米，底高程均挖至33米，5月23日竣工，完成土方33.7万立方米，用工日22.8万个。
1958年2月，微山县又组织民工开挖四里湾5～8号缺口。5～7号缺口各挖宽200米，8号缺口挖宽125米，底高程均挖至34米。至此，1～8号缺口总宽1325米。
1959年春，微山县调集民工堵闭四里湾2～8号缺口，致使南阳湖水下泄受阻，水位抬高，滨湖地区洪涝灾害随之发生。1962年春，济宁地区水建指挥部调集微山县民工，将堵闭的缺口又全部扒开。
1963年4月10日，微山县组织鲁桥、傅村、南阳、马坡、两城、微山岛6公社3100民工，扩挖四里湾5、6号缺口。5号缺口挖长至650米，6号缺口挖长至900米，底宽均挖至196米。5月22日竣工，完成土方7.3万立方米，用工日7.9万个。
同时，济宁市组织民工7900人，扩挖7、8号缺口。7号缺口底宽扩挖至196米，挖长1100米；8号缺口底宽121米，挖长1750米，底高程一律挖至33米。5月20日竣工，完成土方14.5万立方米，用工日15.3万个。
四里湾缺口的陆续开挖，使独山湖的进水量增加，随有开挖邢庄14道缺口之举。
邢庄缺口，位于漕运新渠南阳至满口段。1955年4月22日，鱼台、嘉祥县民工，于开挖四里湾缺口的同时，拓宽加深邢庄缺口。原设计，凡缺口宽不足100米者，一律挖至100米，底高程33米。后因水位抬高，水下施工困难，改变原设计。缺口底高程提高0.2米，缺口宽一般挖至150～200米，最宽者450米。沿新渠70米外弃土，弃土宽20米。5月11日结工，完成土方5.3万立方米，用工日6.3万个。
切除沙滩 安口沙滩，位于二级坝一、二闸闸下5公里处。此沙滩是老薛河、古 水洪积物形成的噘嘴浅滩，高于湖底0.8米，不仅束窄了湖面，而且影响行洪。
1955年5～7月，微山县出民工3500人，首先拆除安口、大捐的捕鱼埝。
1965年4月11日，济宁专署调集嘉祥、金乡县民工4000人，切除安口沙滩，长1500米，底宽400米。30日竣工，完成土方15.67万立方米，用工日10.14万个，国家投资13.37万元。
小卫河以东沙滩。1964年春，微山县调集微山岛、夏镇、傅村、欢城、留庄、两城、鲁桥、马坡等9公社5300民工，切除小卫河以东沙滩，长2400米。堆土宽70米，每隔200米留一50米宽的缺口行洪，完成土方14.3万立方米，用工日15万个。
大卜湾沙滩，位于安口沙滩东，是安口滩地的上游，亦由老薛河、古 水的洪积物堆积而成。
1972年12月，微山县调集傅村、欢城公社3000民工，切除大卜湾沙滩，并结合修筑前、后邵集庄台。1973年2月竣工，完成土方13.3万立方米，用工日15.9万个，国家投资15.3万元。
拆除旧堤坝 1963年4月10日，微山县民工在扩挖四里湾5、6号缺口的同时，组织韩庄、夏镇1100民工，拆除二级坝上下游围埝353米，捕鱼埝123.5米。5月20日结工，完成土方2.1万立方米，用工日3.1万个。7月上旬～8月底，又组织民工200人，配合挖泥船拆除水下部分，完成土方2万立方米，用工日1.2万个。
1963年4月10日，济宁市也组织民工340人，拆除新万福河口李堂桥村南、村西旧堤600米，村西北捕鱼埝300米。5月20日结工，完成土方9200立方米，用工日9500个。
开挖二级坝闸上、下引河 闸上引河。1975年，山东省治淮南四湖流域工程指挥部疏浚队开挖。引河分两股：
一股从水围子村北京杭运河起，东南行通一闸，长3.8公里，宽度由50米渐变至300米，河底高程30.5米；一股通三闸，长3.2公里，宽500米，河底高程30.5米。中间分岔至二闸，岔长1.2公里，底宽330米，河底高程31米。设计完成土方462万立方米。1979年停工，仅完成土方203万立方米，国家投资348万元。
闸下引河。1971年7月～1983年，水电部十三工程局第一分局开挖。引河分东西两股：
东股，上游又分两股，分别自第一、二节制闸开始，行3公里汇合后，穿过大卜湾以东高滩(即安口噘嘴之上段)，经沙谷堆村西，大捐村东，至薪薛河入湖口，转向南。两股共长26.9公里，宽300～320米，底高程30米，完成土方2500万立方米，国家投资3724万元。
西股，原设计分为3段：自第三节 制闸之下向西南，与湖腰扩大深槽相接，长3.95公里为上段；向下至沿河口，长9.35公里，为中段；沿河口以下，沿湖西航道，至鹿口河口再转东南，为下段，长12.5公里。上下段，尚未施工。中段，1978年11月，济宁专署调集金乡、鱼台民工1.5万人，开始修筑排泥区围埝。1979年3月，水电部十三工程局第一分局出动16艘80立方米/时绞吸式挖泥船开挖，1983年基本竣工。河长8.58公里，宽300米，河底高程30米，完成土方890万立方米，国家投资1682万元。