1956年，对私营工商业社会主义改造基本完成之后，个体工商业陆续走上合作化道路，济宁市加入生产合作社和供销社的6374人。1958～1959年，大部分企业生产合作社过渡为地方国营或集体所有制企业，合作商店改为国营商店。1960年，市场管理委员会对私营商贩、交通运输及手工业进行普查登记，共查出2300户，重新登记发证的1277户，其中工业47户，商业1230户；取缔后安排生产的665户，不发证不取缔的358户。经济困难时期，集市贸易的无证商贩逐渐增多，据统计，济宁市无证商贩4431户，从业人员4725人，其中，农村3000户、3000人，城市1431户、1725人。1962年11月，工商部门进行商贩普查登记，到1963年5月，实发证19个行业1585户，其余全部予以取缔。“文化大革命”时期，个体工商业管理混乱，原合作商店转为国营商业，以国营商业为主体，个体商户被赶走，到1975年11月，济宁市自行发展的238户个体工商户全部被取缔，个体商户基本绝迹。
中共十一届三中全会后，国家把个体工商业看作社会主义经济建设的组成部分，重视其发展。1981年，济宁市个体工商业者发展到601户，1984年，发展到2000户，1990年市中区个体工商业（户）发展到4866户，从业人员7885人，拥有资金986万元；私营企业77个，员工992人，资金474万元。个体、私营经营网点4391个，年营业额12620万元，其中商品零售总额9641万元，占区内商品零售总额的28.7%。
1993～1995年，市中区委、区政府每年都召开个体私营经济工作会议，制定《关于促进个体私营经济发展的意见》和修订《关于发展个体私营经济的奖励办法》等，并与各镇、街道办事处签订《发展个体私营经济责任书》。组织镇、办、村、居开展争夺发展个体私营经济“功勋杯”活动；在个体工商户和私营企业中开展争创“功勋”、“明星”、“模范”、“先进”个体工商户或私营企业活动，把发展个体私营经济由部门行为转变为政府整体行为。1995年，市中区个体工商户和私营企业分别发展到7085户和517户，从业人员分别达到14170人和4136人，注册资金分别达到9024.8万元和7480.5万元。