1949年7月，济宁市立人民医院社会保健股代理卫生行政工作，负责市区私医登记、甄审和考试，对合格者发放营业执照。1950年12月，济宁市根据国家卫生部《关于对医院、诊所免征工商税的规定》，对服从卫生行政部门管理，接受一定防疫和保健任务，并按规定标准收取医药费以及不对非就诊病人售药的私立医院、诊所免纳工商业税。1955年，济宁市私医参加联合医疗机构全部结束。是年，私人行医尚有6家6人，均属年老体弱者。1959～1978年，济宁市无公开个体诊所。1979年，少数个体医开始试探性行医。1980年，市卫生局对申请个体开业行医的闲散医务人员，经考核合格者发给营业执照，允许在指定地点行医。1986年起，市中区卫生局每月召集一次个体开业医例会，组织学习上级文件和有关政策、法令，教育其依法行医。是年9月，市中区个体开业行医工作者协会成立，发展会员27人。1989年1月，市中区卫生局下发《市中区个体开业行医管理办法》，要求个体医遵照执行，并定期对其进行检查。至1990年，市中区先后共批准外地和本地在区内个体开业医生41人。1994年9月1日起，市中区卫生局执行国务院颁发的《医疗机构管理条例》，对在区境内开设的私医医疗机构进行清理整顿，批准71家私医医疗机构，核发了由国家卫生部统一印制的《医疗执业许可证》。