清末，境内财政机构称“户房”，财政主管称“户房司爷”，分别管理地丁、漕粮、税捐的征收运解。民国初期，仍沿用旧称。1913年，县公署成立地方财政管理处。1914年，县公署设二科管理财政，下设田粮处、湖田局、烟酒公卖局、卷烟特税局、铁路统捐局、鱼捐局、船捐局。1928年，二科改称财务局，下设田赋征收处、湖（学）田征收委员会。1929年，财务局改称财政局。1930年，财政局又改称二科。1946年1月，市民主政府设财政科。1948年7月，市人民政府设财粮局。
1951年，财粮局改称市人民政府财政科。1953年，农业税并入财政科，称农业税股。1958年，济宁县、嘉祥县并入济宁市，财政、税务合称济宁市财政局。1961年12月，财政、税收分设，对外仍为一个牌子。1965年7月，税务局撤销，其业务并入财政局。1970年12月，财政局改称财税局。1984年4月，财政、税务分设，成立济宁市市中区财政局。至1990年，局内有干部职工26人，其中局长1人，副局长1人，设人秘、预算、企业财务、农业财务、行政财务、预算外、农业基金、监察等科及控制社会集团购买力办公室、国库券推销委员会办公室。
1995年，局内设人秘、预算、企业财务、农业财务、农业税收、行政财务、综合、会计、监察、住房基金管理办公室、控制社会集团购买力办公室和税收财务物价大检查办公室（正科级）、国有资产管理局和信托投资公司（副科级）。有局长2人，副局长2人，干部职工32人。