清末，济宁县公署工房管理农业。民国初期，县公署劝业所管理农业。建国后，市人民政府建设科管理农业。1958年11月，建设科并入基本建设委员会，同时建立畜牧部。1959年4月，农林局建立。1960年1月，农林局分设为农业局、林业局、水利局、畜牧局、农机管理局。1962年5月，上述5个局合并改建为农林局、水利建设指挥部、拖拉机站。1965年6月至1970年，农林局、水利建设指挥部、拖拉机站合并，称农业办公室，有农业技术员4人、水利技术员2人、林业技术员2人、农村经济管理员2人。下辖农业技术站、拖拉机站、畜疫防治站。1973年4月，农业办公室改称济宁市革委生产指挥部农业办公室。1976年10月，生产指挥部撤销，复称农业办公室。1979年10月，建立济宁市农业委员会，1984年改称市中区农业办公室。1990年，农业办公室改称市中区农村经济委员会。至1995年，农委在编干部18人，下辖蔬菜站、种子站、农机站、畜牧兽医站、多种经营站、农经管理站、农技指导站、林业站、农电站、水资源管理站、环境保护站。