1944年5月，昌潍县抗日民主政府设卫生科，境内始有专门卫生行政机构。卫生科有科长1人，科员1人，负责领导卫生医疗工作。
1948年4月，潍北具、潍南县民主政府设立卫生科。10月，潍县（新）民主政府设立卫生科。
1950年2月，潍南县卫生科与潍北县卫生科合并，称潍北县人民政府卫生科。1958年8月，潍北县卫生科与潍县卫生科合并为潍县人民政府卫生科。1955年改称潍县人民委员会卫生科。1953年10月，潍县卫生科并于潍坊市卫生科。1962年1月，潍县卫生科析出，称潍县卫生局。
1967年，卫生局被卫生系统“六·二六”造反组织夺权。1969年成立潍县革命委员会卫生局，后又改为潍县革命委员会生产指挥部卫生组，1970年改称潍县革命委员会生产指挥部卫生局，1976年又改称潍县革命委员会卫生局。1980年底易称潍县卫生局。1984年1月，改称潍坊市寒亭区卫生局。1988年底，区卫生局有正、副局长各1名，工作人员24名，卫生局下设办公室及人秘、业务、计财三个股。