莱山机场属军民合用机场，导航设施由海军保障。1987～1988年，机场进行第一次扩建，导航保障设施逐渐完善。1992年，民航烟台站被国务院批准为国家对外开放货运航空口岸。1997年，被国务院批准为国家对外开放一类航空口岸。2002年，开始第二次扩建。是年，民航莱山机场被评为“山东省文明单位”。
飞行区 1987年开始扩建。跑道由2200米延长至2600米，宽45米，厚0.32米；新增一条长2600米、宽18米、厚0.32米的平行滑行道，为水泥混凝土结构。飞行区设置目视助航灯光系统，主、次降方向均为I类仪表着陆系统，总计45个灯光回路，842套（个）灯具，南、北各设1处灯光变电站。1988年7月竣工启用。2003年1月，机场对南、北灯光变电站低压配电柜及柴油发电机组进行改造，供电运行状态达到机场跑道主、次降方向I类精密进近要求。
停机坪 1988年，民航烟台站新建停机坪，长145米，宽110米，厚0.32米，水泥混凝土结构，总面积1.60万平方米，可停放3架C类系列飞机。1992年7～11月，投资276万元进行扩建，扩建面积1.10万平方米。1993年，再次扩建1375平方米。至2003年，机场停机坪长370米，宽110米，面积4.07万平方米；设有4个c类飞机机位，2个D类飞机机位。
候机楼 1987～1988年，民航烟台站建临时候机楼。1990年5月，开工新建国内候机楼，建筑面积7500平方米，1991年7月竣工启用。1995年5月，国际候机楼开工建设，建筑面积9700平方米，1997年5月竣工并投入使用。1999年5～10月，国内、国际候机楼连为一体，以缓解乘客拥挤压力。2002年3～7月，莱山机场投资4800万元，对国内候机楼进行装修改造，将国内、国际候机楼连接部并入国内候机楼。国内候机楼总建筑面积9909平方米。2003年2～8月，机场投资5356万元，对国际候机楼进行装修改造，扩建国际候机楼到达厅和联检办公区域，总建筑面积1.03万平方米。
航管通信设施 1990年4月，民航烟台站航管楼开工建设，建筑面积1578平方米，1991年7月竣工并投入使用。1997年新建通信楼，建筑面积1650平方米。航管、通信设备主要有雷达终端、单边带收/发信机、雷卡多通道记录仪、甚高频收/发信机、便携式贝克尔、SITTI小内话、程控交换机、自动转报机、航行信息统计终端、航行信息智能处理系统、航行情报处理系统、卫星站PES、卫星TES、对讲机车台、电报终端等。至2003年，境内通信导航站设有中心发报台、航向归航台、MKII航向台、MKII下滑台、MK10航向台、MK10下滑台、全向信标台、南近台、南远台、北远台。
气象观测设施 1992年，新建气象观测楼，建筑面积355平方米。气象设备主要有气象自动观测系统、气象信息网络系统、气象卫星云图接收系统、气象雷达、气象传真广播接收系统等。