市场整治 医疗机构清查 1996年10月，区社发局根据国务院《医疗机构管理条例》规定，对全区医疗机构进行检查清理。检查175处，核发“医疗机构执业许可证”159个，取缔非法行医8处，责令限期整改8处。自1997年起，区社发局每年组织开展1~2次医疗市场集中整治活动，打击非法行医，规范医疗市场秩序。2003年，对全区273处医疗机构逐个进行检查。换发“执业许可证”264个，取缔无证行医9处，查处医疗机构各类违法案件10起。
医疗质量检查 1995年，全区各医疗单位普遍建立健全院、科两级质量管理组织和质量检查制度，严格执行急诊首诊负责制、三级医师查房、疑难病例讨论等医疗规章制度。区社发局每年进行2次医疗质量集中检查。1997年，实行输液行政许可制度，全区所有不设床位的医疗机构，业务用房面积、房屋布局、基本设施等须达到规定要求，输液医务人员经过培训、取得“输液许可证”后方可开展输液业务。是年，取得输液许可的医疗单位72家。2002年11月，区社发局对5处医院的行政管理、医疗、护理、药房服务质量和服务态度以及夜间值班情况等进行一次集中检查，对查出的问题，及时予以处理。2003年，组成专门小组对各医疗单位进行定期巡查，全区医疗质量明显提高。
药品管理 1995年，区社发局联合区工商、公安等部门，利用一个多月的时间，对全区182处医疗机构和涉药单位进行检查，查处假劣药品22个品种，货值5000多元；取缔非法药品经营单位2家，无证行医3家。1996年，在全区医疗卫生单位选聘药品监督员6人，进一步健全药品执法监督网络；对村（社区）卫生所的药品实行由区第一、第二、第三人民医院统一采购分发的办法，理顺药品采购渠道，杜绝非法渠道购药。区社发局与有关部门每年组织2次药品质量大检查，对全区所有药品经营和使用单位逐一进行检查。是年，实行“麻醉药品使用专用卡”制度，患者需用麻醉药品，须经区以上医院确诊后，由区社发局办理“麻醉药品使用专用卡”，到指定医院购买使用。1999年，区政府根据《烟台市纠正医药购销中不正之风工作实施方案》要求，成立莱山区医药市场治理整顿工作领导小组，建立有关部门联席会议制度；区监察局、社发局联合制定《关于纠正医药购销中不正之风的实施意见》，成立由公安、监察、卫生、工商、物价等部门组成的联合检查组，利用两个月的时间，对全区药品生产经营和使用单位进行治理整顿，重点查处无证或证照不全的药品生产经营行为、药品价格违法行为和药品生产、经营企业的不正当行为，打击非法制售药品和非法医疗广告，共查处药品违法经营案件12起。2001年12月，国家新的《药品管理法》颁布实施后，药品管理职能收归市药品监督管理局。2002年，市卫生局在县级以上医院统一实行药品集中招标采购。区社发局将区第一、第二、第三人民医院和烟台大学校医院的药品采购纳入全市集中招标采购，4家医院涉及药品200余个品种。是年，麻醉药品使用审批职能收归市药品监督管理局。