1998年以前，区法院各类案件的受理、审判、执行分别由初家、莱山、解甲庄3处人民法庭自行负责。1998年，区法院建立“立审、审执、审监分立”的审判机制。是年3月，设立案庭，负责各类案件的立案工作，审判与立案分立；设审判监督庭，负责各类案件的再审工作，审判与监督分立。8月，初家、莱山、解甲庄三处人民法庭撤销后，由执行庭负责全部案件的执行工作，审判与执行分立。1999年，建立人民陪审制度，从人民群众中聘任非专职审判人员参与刑事案件审理。从莱山区实验学校聘任2名退休教师担任人民陪审员。2000年1月，实行审判流程管理，由立案庭负责立案、排期开庭、送达法律文书、进行诉讼保全和先予执行，并跟踪监督整个审判流程。实行审判长、独任审判员选任制度，选10名法官分别担任审判长、独任审判员。审判长、独任审判员和执行员拥有独立的审判权和执行权。2001年，实行圆桌式调解，即改以往的“背对背”调解方式为“面对面”调解方式，平均结案时间不超过7天。2002年，改法院直接送达为以邮寄送达（特快专递）为主、其他送达方式为辅的多渠道、快节奏的送达方式，个案送达周期比以往平均缩短6天。2003年，从烟台大学法学院和山东工商学院法律系中聘请12名教师担任人民陪审员，参与房地产、劳动争议、婚姻、合同、刑事、行政案件审理。是年底，正式实行庭前证据交换，实施以举证指导为前提、以证据交换为主线、以庭前调解为重点的审前准备程序。审判周期缩短，审判质量和效率提高。