1994年，莱山区设初家镇、莱山镇、解甲庄镇3个镇级团委，107个村级团支部。自1995年起，莱山区直部门团委（支部）相继成立。1995年5月，中国共产主义青年团莱山区第一次代表大会选举产生中国共产主义青年团烟台市莱山区委员会（机关编制3人）。是年，共青团烟台市公安局莱山分局委员会成立。1998年，共青团烟台市莱山区财政局委员会、建设委员会委员会、地方税务局委员会、区直机关委员会和教育局委员会相继成立。1999年，因区划原因，初家镇团委撤销，新设初家、黄海路、滨海路3个街道团委。至2003年，全区设基层团委21个，团（总）支部200个。
共青团代表大会 第一次团代会 1995年5月4日，在东海宾馆召开，历时1天半。出席大会的正式代表67人。大会审议并通过题为《肩负起光荣的历史使命，为实现莱山区经济和社会发展的宏伟目标而奋斗》的工作报告；选举产生共青团烟台市莱山区第一届委员会。
第二次团代会 1998年5月29日，在烟台大酒店召开，历时1天半。出席大会的正式代表105人，特邀代表10人。大会审议并通过题为《高举邓小平理论伟大旗帜，团结带领全区青年，为实现莱山区跨世纪的宏伟目标而努力奋斗》的工作报告；选举产生共青团烟台市莱山区第二届委员会。
主要工作 青少年教育 1999年11月12日，莱山区第一次少先队代表大会在东海宾馆召开，历时1天。大会通过题为《抓住机遇，迎接挑战，为培养和造就跨世纪的社会主义事业合格建设者和接班人而奋斗》的工作报告，选举产生少先队莱山区第一届工作委员会。2000年4月，团区委举办全区少先队辅导员业务培训班，67名辅导员参加学习。2001年9月，在莱山一中举行成人宣誓仪式。2002年，在全区中小学生中开展“拒绝毒品，关爱生命，做新世纪主人”活动，莱山区实验学校、山东绿叶制药股份有限公司的1500多名团员青年参加签名。2003年6月，组织全区共青团干部和青年代表座谈，开展“解放思想，更新观念，与时俱进，跨越发展”大讨论，共谋莱山区发展大计。
评先创优活动 1997年，团区委组织开展莱山区首届优秀青年评选活动，10名青年受到表彰。1999年4月，开展第二届优秀青年评选活动，10名青年受到表彰。是年，区建委团委、区公安分局团委、山东绿叶制药股份有限公司团支部及8名团员分别受到省、市级团委表彰。2001年，开展“青年文明号”创建活动。市区5路606车组等6个车组被授予莱山区“青年文明号”称号。至2003年，全区获市级“青年文明号”单位11个。
志愿者活动 2000年1月，毓璜顶医院莱山分院12名青年医务工作者到莱山镇敬老院为老人义诊，并赠送1500余元的药品和礼品。3月，近百名团员青年义务到集贸市场分发政策法规宣传材料5000余份，开展法律咨询服务500余人次；近千名学生到街头、市场、社区清理“白色污染”、野广告。5月，区公安分局、国税局、建设局三个单位的20余名青年志愿者，参加烟台市残疾人轮椅捐赠仪式，为残疾人提供周到服务。2001年3～4月，1000余名中学生和300余名青年志愿者义务栽树 4万余株。2001年5月APEC博览会期间,全区团员青年开展“我为APEC博览会奉献什么”的大讨论，烟台大学、中国煤炭经济学院、烟台教育学院、东海宾馆、东方渔港大酒店12名英、韩、日语青年翻译，志愿参与博览会服务活动,受到中外来宾好评。 2002年3月，团区委组织区工商、卫生、司法、税务部门和区第二人民医院的团员干部以及莱山镇初级中学200名中学生志愿者，在莱山镇集贸市场开展法律政策咨询、医疗服务活动，到莱山镇敬老院帮助打扫卫生、为老人理发等。