20世纪90年代初，鸡法氏囊病传入境内。解甲庄镇畜牧兽医站与牟平县兽医站联合采用当地毒株，经多次传代获得鸡胚适应毒F938，制成IBD油剂灭活苗，对雏鸡进行注射，该病得以有效地控制。建区后，区农业站每年组织畜牧防疫专业人员，定期对辖区内各类饲养场、饲养户进行摸底登记、调查造册，重点调查口蹄疫、猪瘟、猪丹毒、猪肺疫、猪囊虫、猪传染胃肠类病，牛布氏杆菌病、牛结核病，鸡新城疫、鸡马立克氏病、鸡白痢、鸡霍乱、鸡瘟、鸡球虫病，兔病、狂犬病等疫病情况，发现疫情，立即采取措施或隔离治疗，做到早发现、早扑灭，杜绝一切蔓延传播途径。区、镇两级畜禽疫病防治部门每年春秋两次对各种畜禽饲养场（户）进行严格消毒，范围包括饲养场区、圈舍、废弃物、粪便、用具、饮用水源等，消毒面积均在100万平方米以上，猪、牛的防疫密度均在97%以上，鸡的防疫密度在92%以上。同时，定期组织兽医卫生检疫人员巡回各养殖场所，稽查产地检疫及屠宰检疫情况，打击抗检、逃检和贩卖、出售病死畜禽的不法行为。上市畜禽及其产品受检率100%，检出的患病畜禽和染疫产品，均做无害化处理。1998年，烟台市莱山区畜牧检疫监督所成立，与区农业站合署办公，负责全区畜禽疫病防治。1994～2003年，境内畜禽未有大的疫情发生。