第一节 军事组织
团练 周时，民间实行保甲制。至五代后晋，发展成民壮、弓手、团练等各类乡兵。唐代设有团练使一职，类似民间的自卫队队长，以管理团练事务。宋代置诸州团练使，明代取消团练使，改以按察使、兵备道分统团练诸务。清末，民间起义众多，八旗、绿营腐化严重，扰民有余，不足以御敌，各地设置团练乡勇，令地方绅士训练乡勇，清查保甲，坚壁清野，地方自保。办团经费均来自民间，团练制度在一定程度上维护了封建地主阶级的统治地位。清咸丰十三年（1853年），招远县村村办团练，县设团练局，统一训练各村团练。由于封建社会的私有制，财产主要掌握在少数地主富户手中，所以民间团练组织实际上是地主武装。封建地主阶级提供经费，雇佣贫民为团兵，维护地主阶级的统治地位。为了抵御纷起的农民起义，马连沟村修建了土圩子，将全村置于土圩子保护之中，四周有大门，日夜有团练负责值守。村团练组织奉县团练局之诏，参与两次与捻军作战。1861年(咸丰十一年)八月二十五日，捻军东征至毕郭。二十七日，团练与捻军激战，双方伤亡严重。1867年(同治六年)，招远团练又与东征之捻军激战一场。
联庄会 1925年，为防匪祸，县内各村纷纷成立护村队。马连沟村借鉴其他村庄经验，成立护村队，经费主要来自富户，由村会统一派遣。为了加强防护力量，与附近村庄组成连庄会，遇有兵事统一行动，共同防范。后，村间串联，组成联庄会。1927年秋，以黑山乡联庄会为骨干约200人，围攻招城，要找贪官污吏算账，因官兵早有戒备即撤。1931年，山东省政府颁布《联庄会暂行条例》规定，将联庄会纳入官办。县设总会，县长任总会长；区设分会，区长任分会长。由于政局动荡，未能实行，联庄会组织自动消亡，但马连沟村民间仍有自动组织的护村护家组织，并持有土枪及长矛等武器。
乡农学校 1935年，县内9个区全部建立乡农学校，既行使区公所的部分权力，又掌握二部分经过训练的乡校武装。规定每30亩地(老亩)出1人1枪，分批轮训，时间1年，后调往正规部队。因富户子弟怕死，多雇人顶替。乡农学校每期训练壮丁30～40人，全县每乡举办2期后，于1937年停办。
抗日自卫团 1938年后，全县农村陆续建立起抗日自卫团。村设村团部，村长任团长，另设专职副团长若干人，负责其日常工作。男18～55岁，女18～45岁者分别编成班、排、连、营编制。其中男18～35岁者编为基干民兵(1945年后改称"子弟兵团")，主要随主力军活动或开展新区工作等；女18～25岁者编为"青妇小队"，主要是担任护理伤员和发动、组织妇女做好支前的后勤工作。1943年，马连沟村建立抗日自卫团，刘玉山任团长。成立20人的民兵队，有手榴弹10枚。1946年，民兵队共有民兵20人，手榴弹10枚。1947年1月，宋云奎任团长。1948年1月，郝奎玉任团长。
民兵 1950年1月，马连沟村抗日自卫团改为民兵队。1958年，建立民兵连。详见第三节。
驻军和过境部队 1912年初，辛亥革命军沪军北伐先锋队第3营约400人在营长刘克厚率领下入驻招远。2月，攻下招远城后，到界河下游一带村庄驻扎过。
1937年8月，国民党军81师师长展书堂率其师部及所属1个团2500余人进驻招远，打着抗日旗号，抽派数万民工伐树毁田，修工事、挖战壕达月余，3条战壕长约50公里，此期马连沟虽无驻军，但年轻劳力多被征调参与挖战壕。日军侵犯胶东时，该师奉行不抵御政策，10月撤离县境。
日军入侵后，由于马连沟紧靠烟潍公路，东邻黄山馆修有日军炮楼，属于敌占区，日伪军经常到马连沟活动，但不在马连沟驻扎。共产党领导的抗日部队，经常凭借马连沟袭扰驻黄山馆日军，一般随战随撤，也有在马连沟村民家中临时驻扎。
1947年9月中下旬，国民党重点进攻胶东，18日进占招城，19日路过马连沟村，部分在村驻扎一夜，翌日撤走。20日国民党军队和还乡团驻黄山馆，经常到马连沟抓人抢掠。11月3日，招远境内国民党军队撤至黄县、黄山馆等地。12月7日，解放军北海主力部队收复黄县城，解放黄山馆。
1968年6～12月，中国人民解放军山东省军区招远县人民武装部2人（一名营级军官，一名连指战员）到马连沟村进行三支两军（支工、支农、支左，军管、军训）。
此后，马连沟一直没有部队驻扎，只有偶尔过境部队短期停留。
20世纪70年代，几乎每年都有部队拉练经过马连沟，有的只是路过，有的短期停留训练。80年代后，过境部队减少。2000年后，过境部队增多，多数在夏季，一般选择海边进行军事演练。2001年7月9日，解放军河南某部神炮营官兵由马连沟村路过，到东良驻训。2003年，解放军某部工程兵营路过马连沟，施工铺设国防光缆。2005年7月，解放军驻潍坊某高炮旅一个营路过马连沟，在北海边黑松林搭帐蓬，驻40多天，进行军训。