1982～1986年，排污费征收项目仅限于污水费和超标排污费。1987年成立排污收费站（1997年改为环境监理站），对排污费征收程序进行规范，凡是向环境排放污染物的单位和项目全部纳入征收范围，包括污水费、超标排污费、粉尘排污费、二氧化硫排污费等，收费额逐年上升。1987年，征收排污费68万元，1988年达到104万元，1992年突破200万元，1999年后一直在300万元以上。1987～2002年，共收取排污费3667万元。
排污费管理实行分级管理，纳入财政预算内资金，按专项资金管理，在市财政局设立排污费专门账户。2000年，实行“票款分离”、“收支两条线”，排污费直接进入银行财政账户，设专人管理。2002年，排污收费纳入招远市行政审批中心，实行网络管理。排污费的使用，严格执行国家环保局、财政部《关于加强环境保护补助资金管理若干规定》以及其他政策和规定。环境保护补助资金，由环保部门会同财政部门统筹安排使用，按照专项资金管理。环境保护补助资金中，排放污水费和超标准排污费的80%用于补助重点排污单位治理污染以及环境污染的综合性治理，20%以及提高的标准收费、加倍收费、滞纳金和罚款，主要用于污染源监测、调查、环境保护宣传教育、技术培训、奖励等。1987～2002年，全市从排污费中返还治理资金948万元，其中1992年返还103万元。