清末，掖县县署设知县1人，为一县行政长官，掌理全县政务。下设县丞署，设县丞1人，为知县佐官，掌理粮马、征税、户籍等；典史署，设典史1人，掌缉捕、监狱等；教谕署，设教谕1人，掌学校、科试等；训导署，设训导2人，协助学官教育所属生员。
清宣统以前，基层政权设乡、社、村三级。乡有乡长、社有社长、村有村长。宣统二年(1910)，推行地方自治，为区(镇)、乡、村三级制。全县划分13个自治区，在城内和沙河镇分别成立筹备自治公所，委任所长。但自治政权尚未建立，清廷即被推翻。
清末知县更迭表
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│姓名 │职务│学位 │到任时间 │籍贯 │
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│杨祖宪│知县│孝廉 │道光十九年(1839)│应山县 │
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│宋澍 │知县│举人 │道光廿三年(1843)│花县 │
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│胡积垲│知县│监生 │道光廿四年(1844)│安徽黟县 │
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│吴以受│知县│举人 │道光廿八年(1848)│阳春县 │
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│胡积垲│知县│监生 │道光廿八年(1848)│安徽黟县 │
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│李廷章│知县│进士 │道光廿九年(1849)│陆川县 │
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│赵开元│知县│进士 │道光廿九年(1849)│恩安县 │
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│周乐清│知县│荫生 │道光卅年(1850) │浙江海宁县│
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│屠道彰│知县│举人 │咸丰四年(1854) │湖北孝感县│
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│宋澍 │知县│举人 │咸丰五年(1855) │花县 │
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│桂昌 │知县│举人 │咸丰七年(1857) │满州镶红旗│
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│许乃恩│知县│举人 │咸丰七年(1857) │浙江仁和县│
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│金宗墉│知县│监生 │同治元年(1862) │吴江县 │
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│苏名显│知县│进士 │同治二年(1863) │交河县 │
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│郑溥 │知县│举人 │同治三年(1864) │大兴县 │
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│郭定柱│知县│进士 │同治六年(1867) │临榆县 │
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│靳昱 │知县│监生 │同治十年(1871) │大兴县 │
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│周士溥│知县│荫生 │光绪元年(1875) │天津县. │
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│耿天九│知县│举人 │光绪六年(1871) │阜平县 │
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│宫本昂│知县│监生 │光绪八年(1882) │泰州 │
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│周源瀚│知县│附监生│光绪九年(1883) │安顺县 │
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│郭道清│知县│廪生 │光绪十一年(1885)│合肥县 │
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│杨才炜│知县│举人 │光绪十二年(1886)│全州 │
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│沈世铨│知县│ │光绪十二年(1886)│阳湖县 │
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│梁嵘椿│知县│进士 │光绪十三年(1887)│广西临桂县│
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│仓尔爽│知县│监生 │光绪十五年(1889)│河南中牟县│
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│魏起鹏│知县│进士 │光绪十六年(1890)│江西南昌县│
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│李子春│知县│ │光绪十八年(1892)│江西武宁县│
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│魏起鹏│知县│进士 │光绪十八年(1892)│江西南昌县│
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│谢端 │知县│ │光绪十九年(1893)│顺天大兴县│
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│续表 │
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│姓名 │职务│学位│到任时间 │籍贯 │
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│魏起鹏│知县│进士│光绪十九年(1893)│江西南昌县│
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│杨德成│知县│ │光绪廿年(1894) │江西德兴县│
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│王秉悫│知县│ │光绪廿一年(1895)│四川华阳县│
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│逯蓉 │知县│进士│光绪廿一年(1895)│直隶东明县│
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│王秉悫│知县│ │光绪廿一年(1895)│四川华阳县│
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│罗崇鼎│知县│进士│光绪廿二年(1896)│福建侯官县│
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│潘民表│知县│举人│光绪廿二年(1896)│江苏阳湖县│
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│张星源│知县│ │光绪廿二年(1896)│河南渑池县│
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│敬璐 │知县│进士│光绪廿三年(1897)│满州镶白旗│
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│刘思诚│知县│举人│光绪廿七年(1901)│顺天武清县│
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│孙颖 │知县│ │光绪廿八年(1902)│浙江海宁州│
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│饶介旗│知县│ │光绪廿八年(1902)│江苏南城县│
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│敬璐 │知县│进士│光绪廿九年(1903)│满州镶白旗│
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│张世卿│知县│ │光绪卅一年(1905)│河南固始县│
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│秦崧年│知县│ │光绪卅二年(1906)│四川忠州 │
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│吕翌 │知县│ │光绪卅二年(1906)│江苏湖阳县│
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│阮忠模│知县│ │光绪卅二年(1906)│安徽合肥县│
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│萧殿芬│知县│拔贡│光绪卅三年(1907)│四川开县 │
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│刘孝祜│知县│举人│光绪卅四年(1908)│福建闽县 │
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│钮家枢│知县│举人│光绪卅四年(1908)│浙江乌程县│
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│陈钜前│知县│贡生│宣统元年(1909) │福建闽县 │
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│王其浚│知县│ │宣统二年(1910) │江苏上元县│
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│刘孝祜│知县│举人│宣统三年(1911) │福建闽县 │
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│边度春│知县│ │宣统三年(1911) │奉天锦县 │
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