龙口市天然水资源总量多年平均为35197万立方米，平均每人占有636立方米,为山东省人均920立方米的69.1％，为全国人均2700立方米的23.5％。其中，可利用水资源量为24415万立方米,平水年与全市国民经济各部门需水量相比,尚缺4154万立方米。1988年，可利用的水资源总量为1.0亿立方米，总需求量达2.82亿立方米，缺水达1.82亿立方米。连续超采地下水静储量,使全市地下水位持续下降:西部平原区1986年、1987年、1988年的地下水位,分别比1976年下降了12.74米、13.83米、15.67米;黄水河流域平原区，1988年比1976年下降7.99米。1989年，西部平原“负值漏斗区”达157平方公里，占西部平原总面积的58.15％，西部沿海地下水氯离子含量大于250毫克/升的海水侵染范围达85.7平方公里，占31.7％。
地表水龙口市多年平均降水量为626.3毫米，降水总量为52609万立方米，人均占有910立方米，为山东省人均占有量的56.21％，为全国人均占有量的14.7％。耕地亩均占有量921.3立方米。市内多年平均径流深为179.5毫米，河川多年平均径流量为26301立方米，耕地亩均占有河川径流量为264立方米，为山东省人均占有量350立方米的75.4％，为全国人均占有量的15％。地表水可利用量为8845万立方米，占多年地表径流量的33.6％，每年平均有1亿立方米地表径流注入渤海。市境地表水受污染较重，王屋水库汞的含量超出生活用水标准，超出渔业用水标准2倍，北邢家水库酚的含量超出生活用水标准5倍，超出渔业用水标准1.5倍。
地下水全市地下水静储存量有48276万立方米。多年平均地下水净补给量为16410万立方米，可利用量多年平均为14596万立方米，丰水年为16960万立方米，平水年为14391万立方米，枯水年为12712万立方米,特枯年为11064万立方米。地下水质一级占24％，二级占56％,三级占16％，四级占4％。酚、氰、砷、汞和六价铬，检出率为68％，多数没超出灌溉用水标准，属轻度污染。其中，黄山馆、中村、北马、邹家洼、黑山河两岸等地下水酚的含量超出生活用水标准5倍，黄河营、小河口、黄山馆、港栾等井水氯化物的含量超出生活用水的1～2倍。1988年，氯离子含量最高的达9520毫克/升，是1977年的36.8倍。地下水分在平原地区的为松散岩类孔隙水，含水砂砾石厚1～10米，层数3～7层，其中夹层有砂质粘土等，多为承压水。近海滨有潜水，流向由东南至西北，水位埋深1～20米。在中村以东，芦头北、簸箕栾家、柳海一带，单井涌水量大于1000立方米/日，龙口、海岱仲家、北马镇以北、芦头、新嘉疃、南乡城一带,单井涌水量为500-1000立方米/日，闫家店、小陈家、芦头南、东江格庄及城关镇附近单井涌水量小于500立方米/日。地下水分布在平原区以南、以东的低山丘陵区为基岩裂隙水。水位埋深2～20米，民井最大可能涌水量为0.2～0.3升/秒。泉水流量0.01～3.4升/秒。