市境内共有河流23条,干流总长123公里，流域面积1349.6平方公里。黄水河、泳汶河、北马南河、八里沙河为境内主要河流。除黄水河、八里沙河外，其余河流皆为境内河流，属季风雨源型河流，降雨量决定水流量。汛期水势骤涨，源短流急，由东南山区曲折西北行，旱季断流干涸。
黄水河为境内最大河流。地理位置约位于东经120°30′～120°40′，北纬37°30′～37°30′50″之间。发源于栖霞县猪山、狼当顶和寺口西境十字坡，流经丰仪乡、田家乡、文基乡、石良镇、兰高镇、诸由观镇和羊岚镇于黄河营村东注入渤海。干流总长55公里，市内长32公里，流域面积1005平方公里。河道宽150～200米。1959年，其中上游建一大型水库--王屋水库，总库容1.49亿立方米。其支流汇入左右对称分布均匀呈羽状河系，境内主要支流有9条:黑山河，位于龙口市东南部田家乡南，源于招远县桃园子顶。流经田家乡的黑山村，冯家村、庙曲家村，雀山姜家村，前迟家村等，注入王屋水库。全长10公里，市内长6.6公里，河道宽平均30米。莱茵河，位于龙口市东南部文基乡南，源于莱山和绛山之间。流经七甲乡和文基乡入黄水河。全长12公里，河道宽40米。上游建小〈二〉型水库一座。鸦鹊河，位于龙口市东部兰高镇东，源于莱山北麓。流经文基乡和兰高镇入黄水河，全长10公里，河道宽30米，流域面积29.1平方公里。上游建小〈二〉型水库两座。绛水河，位于龙口市东部，源于绛山。流经东江、城关、羊岚三镇入黄水河。全长23公里，河道平均宽50米，上游建小〈二〉型水库一座。其主要支流是龙湾河和矫家河。龙湾河源于凤凰山北麓，长7.5公里。源于凤凰山东麓的青龙河，长5公里，流经兰高镇的沟吕家，殷家，兰高汇入龙湾河。矫家河源于东江镇祁家村周围，长12.5公里，经东江镇、新嘉镇、城关镇、羊岚镇入绛水河。东营河，位于龙口市东南部石良镇南，源于石良镇东竹园村东山。流经东竹园、后柳家、东营曹家，南刘家等村入黄水河。全长9公里，河道宽50米。上游建小〈一〉型水库一座。黄城集河，位于龙口市东部石良镇黄城集村南。源于蓬莱县艾山。流经石良镇入黄水河。全长31公里，市内长8.5公里，河道平均宽120米。其主要支流平里河，位于石良镇平里院村西，源于盒山。流经山后曹家、山后孙家、山后柳家、平里院等村入黄城集河。全长8.5公里，宽50米。荆家河，位于龙口市东部诸由观镇荆家村南，源于蓬莱县于家庄北山。流经荆家、董家、大宗家等村入黄水河。全长9.5公里，市内长6公里，河道宽50米。丛林寺河，位于龙口市东北部诸由观镇南，源于蓬莱县牛山西麓。流经观张家、西张家村入黄水河。全长13公里，市内长2.5公里，河道宽50米。凉水河，位于龙口市东部，兰高镇侧高村东侧。源于文基乡慕家村南 。流经文基乡、兰高镇入黄水河。全长5公里，河道平均宽12米。
泳汶河源于罗山北麓。流经下丁家、芦头、新嘉、北马、乡城、中村七镇入渤海。干流总长36公里，河道宽100米，流域面积205平方公里。1960年其上游修一中型水库。其主要支流南栾河，位于北马镇南栾堡东，源于招远县美秀顶，流经芦头镇、大陈家镇、北马镇入泳汶河，全长18公里，市内长13公里，河道平均宽80米。1960年在河的中段修一中型水库。
北马南河位于北马镇南，源于招远县石棚南山。流经大陈家镇、北马镇、海岱镇入渤海。全长17公里，流域面积62.6平方公里，市内长15公里，河道平均宽30米。上游建一小〈一〉型水库。此河原名恒河，又名吕家疃河。其主要支流有河里张家河，位于大陈家镇河里张家村东，源于狗山北麓，流经大陈家镇、北马镇入北马南河，全长8公里，河道宽15米。
八里沙河位于海岱镇曹家村南，源于招远县马格庄东南山。流经市内大陈家镇、海岱镇入渤海。全长15公里，流域面积77平方公里，市内长9公里，河道平均宽30米。其主要支流安家河，位于安家村南，源于安家水库上游山区，长2公里，宽10米。
苏家沟河位于龙口市西南部，源于苏家沟水库上游山区，注入渤海。长6公里，宽10米。
曲栾河位于龙口市北部乡城镇的曲谭和港栾村中间。源于乡城镇周围的村庄，流入渤海。长8公里，宽20米。
界河位于龙口市西南与招远县交界处，源于招远县境尖尖山南麓。流经黄山馆西南界入渤海。全长45公里，龙口市与招远县交界段长4公里，河道宽平均100米。流域面积572.5平方公里。每年丰水期最大径流量为600立方米/秒。