元朝，区划为2社，南五岛为沙门岛社，北五岛为牵牛岛社。
明朝洪武二十七年(公元1394年)，因有战事岛民外迁而空岛，行政区划无考。
清朝道光年间，为开垦海岛设立13社。
1928年7月，驻岛奉系海军设立长山八岛民政局，对区划进行调整，但仍划13社。
1934年底，长山八岛特区行政专员公署改社为乡，行政区划无变更。
1945年9月下旬，长山岛军政办事处区划为3区。其中，庙岛区辖南长山岛、北长山岛、大黑山岛、小黑山岛和庙岛诸村，砣矶区辖砣矶岛诸村，钦岛区辖大钦岛、小钦岛、南隍城岛和北隍城岛诸村。11月，长山岛特区政府区划调整为4个区。其中，玉石区辖南长山岛和北长山岛诸村，庙岛区辖庙岛、大黑山岛和小黑山岛诸村，砣矶区和钦岛区的区划未变。1946年3月，区划调整为6个区，即玉石区、庙岛区、黑山区、砣矶区、钦岛区、隍城区。
1947年10月1日，国民党长山列岛区署区划为6乡，即长岛乡、连岛乡、蓬岛乡、庙岛乡、砣岛乡和钦岛乡。
1948年3月31日，国民党“长山八岛设治局”第一次行政会议(此会议系长山八岛设治局待批准之前召开的会议)决定，将区划调整为7乡1独立保，即中山乡、中正乡、率真多、黑山乡、砣矶多、钦岛乡、隍城乡和庙岛独立保，下设37个保。
1949年8月12日，长山岛特区政府区划为6个乡、38个行政村。
1955年12月至1956年2月，以行政村或凡个行政村联合建成生产合作社。
1958年11月1日，长岛县改建为公社，原县辖乡改称大队，原乡所辖生产合作社改称生产队。
1962年4月，长岛人民公社改建为长岛区，原社辖大队改称公社，原大队辖生产队改称生产大队。6处公社为南长山公社、北长山公社、黑山公社、砣矶公社、钦岛公社、隍城公社。
1963年恢复长岛县，行政区划无变更，仍为公社、大队。
1982年1月1日，南长山公社改建为长岛镇。1984年3月19日，砣矶公社改建为砣矶镇，长岛镇更名为南长山镇，其它4处公社改建为乡。1985年3月1日，区划为2镇8乡。
附：
1939年9月18日，伪长山八岛专员办事处，行玫区划沿用13乡。
1941年9月，成立长山岛区，行政区划无变更。表1一1长岛清朝道光年间行政区划一览表
表1-1 长岛清朝道光年间行政区划一览表
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│社名 │村名 │所辖居民岛 │
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│寺后社 │寺后村刘家村后沟村山前村山西坡村 │长山岛 │
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│鹊嘴社 │鹊嘴村孙家村范家村赵家村王家村 │ │
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│南城社 │南城村荻沟村 │ │
├──────┼──────────────────┼────────┤
│王沟社 │王沟村黑石嘴村呼夼村(连城村) │ │
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│北城社 │北城村山后村黄巷村(嵩前村) │ │
├──────┼──────────────────┼────────┤
│店子社 │东村西村花沟村 │ │
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│北庄社 │北庄村土岛村 │大黑山岛 │
├──────┼──────────────────┼────────┤
│南庄社 │南庄村船旺村骆家村陶家村大濠村小濠村│ │
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│小黑山岛社 │小黑山村 │ │
├──────┼──────────────────┼────────┤
│庙岛社 │庙岛村山前村 │庙岛 │
├──────┼──────────────────┼────────┤
│钦矶社 │吕山口村井口村大口村后口村磨石嘴村 │砣矶岛 │
├──────┼──────────────────┼────────┤
│钦岛社 │东濠村小濠村北疃村南疃村小钦岛村 │大钦岛小钦岛 │
├──────┼──────────────────┼────────┤
│南北隍城岛社│山前村山后村南城村 │北隍城岛南隍城岛│
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表1-2 长岛1928年行政区划一览表
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│社名 │村名 │所辖居民岛 │
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│西山社 │寺后村鹊嘴村刘家村后沟村山前村 │南长山岛 │
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│东山社 │孙家村赵家村王家村范家村 │ │
├────┼──────────────────┼────────┤
│南城社 │南城村荻沟村 │ │
├────┼──────────────────┼────────┤
│连城社 │连城村黑石嘴村王沟村 │ │
├────┼──────────────────┼────────┤
│北城社 │北城村山后村嵩前村 │北长山岛 │
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│北店社 │东村西村永安村(花沟村) │ │
├────┼──────────────────┼────────┤
│庙岛社 │庙岛村山前村 │庙岛 │
├────┼──────────────────┼────────┤
│小黑山社│小黑山村 │小黑山岛 │
├────┼──────────────────┼────────┤
│北庄社 │北庄村善人庄村(土岛村) │大黑山岛 │
├────┼──────────────────┼────────┤
│南庄社 │南庄村船旺村骆家村陶家村大濠村小濠村│ │
├────┼──────────────────┼────────┤
│砣矶社 │大口村吕山口村井口村磨石嘴村后口村 │砣矶岛 │
├────┼──────────────────┼────────┤
│钦岛社 │北疃村南疃村东濠村小濠村小钦岛村 │大钦岛小钦岛 │
├────┼──────────────────┼────────┤
│隍城社 │山前村山后村南城村 │北隍城岛南隍城岛│
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表1-3 长山岛特区1946年行政区划一览表
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│区名 │村名 │所辖居民岛 │
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│玉石区│寺后村刘家村鹊嘴村连城村荻沟村南城村山前村王沟村黑│南长山岛 │
│ │石嘴村后沟村山东村 │ │
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│庙岛区│北城村店子村嵩前村庙岛村山前村 │北长山岛庙岛 │
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│黑山区│南庄村北庄村土岛村大濠村小黑山村 │大黑山岛小黑山岛│
├───┼─────────────────────────┼────────┤
│砣矶区│大口村井口村吕山口村后口村磨石嘴村 │砣矶岛 │
├───┼─────────────────────────┼────────┤
│钦岛区│东濠村北村南村小濠村小钦岛村 │大钦岛小钦岛 │
├───┼─────────────────────────┼────────┤
│隍城区│山前村山后村南城村 │北隍城岛南隍城岛│
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表1-4 长岛县1985年行政区划一览表
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│乡镇名称│村名 │所辖岛屿 │
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│南长山镇│乐园村鹊嘴村荻沟村南城村黑石嘴村连城村王沟村后沟村│南长山岛 │
│ │山前村孙家村赵王村 │ │
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│砣矶镇 │中村西村北村东山村井口村吕山口村后口村磨石嘴村 │砣矶岛砣子岛东嘴石岛山│
│ │ │嘴石岛 │
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│北长山乡│北城村嵩前村店子村花沟村 │北长山岛螳螂岛挡浪岛蝎│
│ │ │ 岛马枪石岛 │
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│庙岛乡 │庙岛村庙岛山前村 │庙岛羊砣子岛牛砣子岛烧│
│ │ │饼岛 │
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│大黑山乡│北庄村土岛村南庄村小濠村大濠村西大濠村 │大黑山岛南砣子岛鱼鳞岛│
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│小黑山乡│小黑山村 │小黑山岛犁犋把岛 │
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│大钦岛乡│北村南村小浩村东村 │大钦岛 │
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│小钦岛乡│小钦岛村 │小钦岛鳖盖山岛 │
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│南隍城乡│南隍城村 │南隍城岛坡礁岛 │
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│北隍城乡│隍城山前村山后村 │北隍城岛 │
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*尚有猴矶岛、小猴矶岛、高山岛、小高山岛、车由岛、小竹山岛、大竹山岛未进行区划。