1929年，牟平始设私立医院。1946年5月，县政府在牟平城内建大众医院。1958年9月，在乡镇保健站的基础上分两批建公社医院17处。1968年，推行农村合作医疗制度，并建立大队合作医疗室644处。1979年，全县有医务人员861人，病床位662张。之后，医疗队伍逐年扩大，医疗技术不断提高，医疗器械日趋先进，多种疑难病症被列入常见病防治范围，传染病的发病率逐年下降，某些传染病基本消灭或完全消灭。至2000年，全区有综合医院23处，专科医院5处，基层卫生机构640处，个体诊所119处。有医务人员2739人，病床位1262张。