牟平港海区属于烟台港水域，烟台港监巡航船负责其辖区内海上巡航任务。设发讯、收讯台与海上航行船舶进行通讯联络。牟平港航监督站按照国家有关法规，管理航运船舶（国内渔船船检由养马岛渔港港监负责），主要进行航运船舶主机设备、船体设备、安全设备等技术检验，核发技术证书，登记所有权和进出港签证等。同时对船长、轮机长、船员、船舶报务员等进行统一考试和核发职务证书，纠正无证操作和职证不符等混乱现象。国际来港船舶进出港口，由港监站会同海关、卫生检疫、公安边防等部门，对船舶证书、操作设备、无线电设备、救生设备、防污设备及装载情况进行联合检查，并由港监指派引船员强制引航。对国内来港船舶的检验与国际船检相同，但不强制引航。港监站还定期进行海区污染检查。