境内有良种猪场2处：区畜牧良种场、东油坊畜牧良种猪场。蛋鸡种场2处：区外贸公司种鸡场、区良种蛋鸡研究所；肉食鸡种鸡场4处：蛤堆后种鸡场、南杏林堡外贸种鸡场、南莒城刘杰种鸡场、姜志峰种鸡场。
一、烟台市牟平区畜牧良种场
1971年建县畜牧场，1975年改称县养猪良种场，全民所有制事业单位，隶属县农林局。1985年改称县畜牧良种场，先后隶属县畜牧局、农牧局、畜牧生产防疫中心、区农业局。主要繁育推广优良品种猪。全场占地66.6万平方米，其中耕地20公顷。办公建筑面积4600平方米，畜禽舍建筑面积1.99万平方米，有150吨冷藏厂1座，化学试剂加工设备1套，汽车1辆，拖拉机3台，履带式拖拉机1台；固定资产257.4万元，流动资金99万元。2000年，干部职工36人，其中技术人员8人，系省重点良种猪繁育场。以畜禽良种繁育推广为主，兼营粮油、果业生产等。该场先后饲养烟台黑、内江、荣昌、新长白、大约克等良种猪，累计向社会推广良种猪5万多头，提供肉类1000余吨。推广莱航、英国红、海蓝红等良种鸡300多万只，提供鸡蛋3000余吨。1978～2000年，年均收入51.1万元，利润3.38万元。
二、宁海镇东油坊畜牧良种猪场
1980年建，是集良种繁育与杂交育肥于一体的大型综合性猪场。2000年，存养良种母猪600头，杂交母猪100头。年出栏良种猪5000余头，是山东省良种猪定点一级繁育场。
三、烟台市牟平区良种蛋鸡研究所
1984年5月成立，地址在大窑兽医站院内，隶属区兽医站。占地5300平方米，建筑面积1800平方米，固定资产25万元，流动资金30万元。2000年，有干部职工10人，其中技术人员3人。有孵化器4台，发电机、搅拌机各1台。饲养蛋鸡5000只，孵化鸡20万只，年收入20万元。1992年被评为牟平县先进民办科研所，1995年鸡用乳头饮水器试验与开发项目获烟台市科技进步二等奖。