一、动物防疫
牟平建有区、镇、村三级动物防疫网络，开展畜禽疫病的常规免疫、流行性疫病的防治控制工作。1970年，马鼻疽病被根除；1990年后，猪传染性水泡病、猪囊虫病、鸡马立克氏病、鸡产蛋下降综合症、牛结核、马传贫无临床病例发生；1992年，经省畜牧局和5省卫生厅验收，境内人畜共患的布氏杆菌病的防治，达到控制标准。猪瘟、猪丹毒的免疫密度达98%以上；鸡新城疫免疫密度达95%以上。1999～2000年，重点对牲畜口蹄疫实施强制免疫。2000年，制定控制方案和相应的防治措施，对猪瘟、牲畜口蹄疫、鸡新城疫、鸡传染性法氏囊病、兔病毒性出血症进行重点监测和普查，促进全区畜牧业健康发展。
二、动物及动物产品检疫
1985年国务院颁发《家畜家禽防疫条例》以后，牟平的畜禽检疫工作逐步走上正规。其间，农业部印制检疫证明和验讫印章，由兽医站逐级领取使用。同时，对全县48名乡镇专职检疫人员进行培训、考核，考试合格后择优录用。按照条例规定，对畜禽产地、屠宰、市场、运输等环节实施检疫和检验。1998年1月，牟平畜牧防疫部门按照《中华人民共和国动物防疫法》的规定，对动物及动物产品实施检疫和检验；对动物防疫监督检疫人员进行集中培训、考核，提高业务技能和执法水平。建立健全动物及动物产品检疫机构，全区设1处兽医卫生监督检验所和15处动检站，配备动物防疫监督检疫人员110人。年均检疫活畜禽142万头（只），检验畜禽产品3000余吨。对检出的患病畜禽和染疫产品，均做无害化处理，防止疫病的蔓延和扩散。