1990年，成立以县政府分管副县长为组长，民政、卫生、残联等部门组成的全县三项康复工作领导小组，建立康复工作体系，残疾人康复工作开始实施。1996年后，康复工作发展迅速，康复任务由原来的三项（小儿麻痹、白内障、聋儿）扩展到八项（白内障复明、低视力康复、聋儿康复、精神病防治、麻风畸残康复、康复训练与服务、用品用具供应服务、特需人群补碘），并初步形成以区人民医院、区中医院、牟平整骨医院为骨干的康复中心，各镇卫生院为社区康复工作站，各行政村卫生室为康复点的全区康复工作体系。1997年10月，牟平区康复中心建成。1990～2000年，全区共实施白内障复明手术1032例，低视力配带助视器48人，小儿麻痹矫治手术37例，语训聋儿22人，培训弱智儿童20人；装配假肢、矫形器118人，肢残系统训练61人；残疾人用品用具供应1500多件。在此期间，区卫生局牵头，建立了区、镇、村三级精神病康复网络，精神病防治所负责全区精神病康复预防治疗工作，1000多名重性精神病患者得到不同程度的康复治疗。