一、烟台市牟平区人民检察院
1951年8月，牟平县人民检察署成立，1955年1月改称县人民检察院。“文化大革命”中县检察院受冲击瘫痪。1978年6月重新建立，检察干警10人。1979年11月，检察院设办公室、刑事检察一股和二股及法纪检察、经济检察、监所检察股，检察干警40人。1982年4月，增设控告、申诉股和政工、技术二科。1985年定编50人，实有45人。1988年增编10人。1995年1月，改称烟台市牟平区人民检察院，检察干警91人。2000年，编制71人，实有84人。主要职责是：依法对贪污贿赂犯罪、国家机关工作人员的渎职犯罪等重大犯罪案件进行侦查；依法审查、决定是否逮捕、起诉或不起诉；依法对区人民法院的刑事诉讼、民事审判和行政诉讼进行法律监督；负责向区人民代表大会及其常务委员会报告工作。
二、下属单位
反贪污贿赂工作局 1979年11月，设立经济检察股，后改为科。1990年2月，更名为贪污贿赂检察科。1993年10月，撤销贪污贿赂检察科，成立反贪污贿赂工作局。1995年1月，更名为烟台市牟平区人民检察院反贪污贿赂工作局。2000年4月升格为副科级单位，工作人员15人。
渎职侵权检察局 1979年11月，设立法纪检察股，后改为科。2000年4月，撤销法纪检察科，成立烟台市牟平区人民检察院渎职侵权检察局，为副科级单位，工作人员4人。
司法警察大队 2000年9月成立，股级单位，受区检察院和烟台市检察院司法警察支队双重领导，编制7人。
乡镇检察室 1996年12月，烟台市牟平区人民检察院乡镇检察室成立，对外称烟台市牟平区农村经济检察室，为副科级单位，编制4人。