一、区委班子自身建设
历届区（县）委领导班子重视学习党的路线、方针、政策，马克思著作、列宁著作与毛泽东著作、邓小平理论、中国特色社会主义理论、市场经济理论和法律知识等，建立学习日制度，并每年选派部分常委到市委党校和省委党校进行培训。注重班子的年轻化、知识化和选拔培养妇女干部。培养35岁以下年轻干部和女干部进常委班子，在五、六、九、十届区（县）委中，都有一名女常委。常委班子成员均达到大专以上学历。常委班子每年召开两次民主生活会，开展批评与自我批评。实行“领导干部包村蹲点制度”，每位常委联系一个镇，包一个村，每年下乡蹲点不少于一个月。1999年4月，在全区开展的“助民连心”活动中，31名区级领导干部为贫困学生捐款5万余元。在“三讲”教育中，常委班子开展健康的思想剖析，以增强政治上的坚定性和群众观念。
二、农村党组织建设
1981年12月，县委针对农村党支部班子软弱涣散问题进行集中整顿。1990年，县委制定《牟平县创建“农村党的建设工作先进县”实施规划》，按照“一类班子上水平、二类班子上台阶、三类班子变面貌”的要求，采取“抓两头、带中间”的工作方法，开展农村党建工作。各乡镇党委和农村党支部普遍建立健全党务工作、党的生活和党建目标管理等制度，建起农村干部、党员和村级组织档案，完善村委会及妇女、共青团、民兵组织，健全率由原来的60%提高到80%；农村党员活动室开设率达到90%以上；农村一类班子由原来的40%提高到50%，三类班子由原来的5.6%下降到4.7%。1991年，牟平县被省委评为“农村党建工作先进县”，宁海、武宁、莱山3处乡镇被市委评为“党建工作先进乡镇”。1994年底，县委提出实施农村党建“三大工程”：强村班子优化工程，中间村班子改型工程，后进村班子改造转化工程。1996年，区委总结推广宁海镇的经验，在全区农村开展创建“五好”党支部活动，同年底，有70个农村党支部被区委命名为“五好”农村党支部。1991年，县委制定《关于经济发达村党的建设工作的意见》，加强经济发达村领导班子的思想、作风、纪律等方面的建设。1993年起，在经济强村推行党、政、经“三位一体”或“两位一体”的领导体制，即党支部书记、村委会主任、总经理一人兼或党支部书记、村委会主任一人兼。至1995年，全区实行“三位一体”或“两位一体”的经济强村达到71个。1996年，区委、区政府出台《关于加强乡镇企业经营者队伍建设的意见》，建立评选、奖励先进企业和农民企业家队伍制度。到2000年底，先后有18名农村党支部书记、乡镇企业厂长经理挂任副乡镇长以上领导职务，其中9名挂任镇党委副书记；11名强村（企）干部转为国家干部。
三、企业党组织建设
1978年，企业实行书记负责制，党企不分。1988年在企业深化改革中，全县155个县属中小型企业实行厂长兼书记的领导体制。1990年，县委为厂长、书记“一人兼”企业配备专职副书记79人。同时，企业普遍设立党务、政工机构，并按照千人以上的企业按职工总数0.6～0.8%，500～1000人的企业按职工总数0.8～1%，500人以下的企业按职工总数1～1.2%的比例，配备专职党务和思想政治工作人员930人。1990年县直企业党委撤销后，将其所管理的7大系统48个企业，按行业设置6个系统党委，配齐党委书记、专职副书记、组织、宣传委员和纪委书记，并结合企业第二轮承包，对企业党的工作普遍实行年度目标责任制。企业主管党委与所属企业党组织签订目标责任书，企业党组织也普遍将工作目标逐项分解到科室、车间和班组，落实到人。