一、港口
1.龙门港：
位于东西泊子迤北，县城西北10公里。此港历史悠久，州志曾以“龙门归帆”列为宁海州十大景之一。同治三年以前已经淤塞，仅通渔舫。
2.养马岛港：
位于养马岛西端，北起养马岛，南至宁海镇，东西长2.5公里，南北平均宽300米，并弯曲转向西南，而后折北，注入黄海。港东有连岛公路。码头设在港湾西北侧，1979年，采用花岗岩石方块砌成直壁重力式结构。货场4000平方米，码头长108米，可同时停泊200马力船舶3艘。港区陆域面积2万平方米。码头上安装2台8吨重电吊。
另有葫芦头港(东庙江港)，位于养马岛东端，东西长O.5公里，南北长0.5公里，水深6米。可停泊船只，兴盛于明末清初，今停废。
3.金山港：
为渔港，兴盛于清末民初。民国21年6月9日，烟台——金山港通航。位于姜格镇西北海岸12公里，现仍为渔港。
4.系山口：
位于北系山西北侧，曾为摆渡渡口。1979年5月，跨海连岛大坝建成后废。
5.洪口：
位于养马岛镇洪口村南，曾为摆渡渡口。1957年废。 6.牟平港筹建计划 1985年8月15～17日，山东省计委和省交通厅主持召开可行性研究工程论证会，交通部委派2名代表参加，会议决定在牟平县牟山后(养马岛西庙汀对岸)建5000吨级码头， 10月批复立项。11月，中央交通部全国“七五”期间中小港口建设计划会议正式确定牟平港投资形式为部、厅、县三级筹办，各投资1／3，拟定1987年3月正式动工。
二、航道
养马岛港可利用水域面积60万平方米.港池水域面积3万平方米。水深大部分在3～5米。该港系正规半日潮，最高潮位+2.68米，最低潮位－0.2米，平均潮位+2.11米，平均低潮位0.51米。常风向为西南风，强风向为东北风，风速为39.6米／秒。
养马岛港为渔、商两用港口，规模较小，内外航道无明显划分。自古迄今，货船、渔船不定期往来，未有固定航线。1984年，建有导航助航设备：左侧标①位于北纬37°26＇45"，东经120°34＇09"，闪红1.5秒；左侧标②位于北纬37°26＇35"，东经120°34＇31"；左侧标③位于北纬37°26＇35"，东经120°34＇46"。
三、航运
1.海运工具：
牟平县早期海运，多以舢舨、帆船为主。清光绪六年(1880)有汽轮往返于芝罘——养马岛——成山之间。清末民初县境南北海岸运输(包括今乳山浪暖口、洋村口)，大小帆船百余只，其中“大瓜篓”、“燕尾”等大帆船载重量达200～250吨。民国年间，轮船逐年增多，帆船减少。民国21年(1932)，烟台商号货轮“第一长安”号载重47吨位，每日往返于烟台——金山港。大部分帆船被迫出卖或自拆。建国后，船舶大有发展。1965年，始将舢舨改成机动船。驻岛部队增添军用机动驳船。70年代初，县内增置水泥船，后因不耐用而报废。80年代海运工具朝着高马力的方向发展。1985年8月，宁海镇新牟里全洲海运公司购进荷兰产5000吨位408O马力远洋货轮1艘。
2.客货运输：
货运 据《元史.食货志》记载：元至元十九年(1282)起，海上总管罗壁、张瑄、朱清等开始自长江口海运粮食至直沽(今天津)，再转内河至京，相沿至天历二年，累计运粮近亿石。据所记其行船路线，知其必经牟平养马岛。《牟平常大兴兴衰史》记载：清末，养马岛洪口村杨氏开设海州铺，专门从事海上运输，往返于养马岛与苏州、扬州之间。海州铺有船两只，取名“大瓜篓”、“小瓜篓”，载重1200石以上，著名的宁海绸就是由大，小瓜篓运往江南各地。清光绪二十三年(1897)，官府曾将沿海产的食盐3.5万石，由养马岛装船运往海参崴。宣统元年(1909)，烟台毛合兴船行成立，有轮船“新履云号”，100马力，载重38吨位，往返于烟台与养马岛之间，年500次。当时，全县有大小帆船百余艘。
民国年间，虽轮船大增，但仍有一些富户乘风船到外地交易，南航上海。广州，北抵天津。抗日战争时期，因日伪封锁海港，海运萧条。民国35年(1946)，全县仅剩下帆船10余艘，计300余吨位。远航烟台.大连等地，出口物资主要是食盐，进口以煤、木材、杂粮为多。民国37年，国民党军队虽封锁海运，但仍有帆船夜间远航大连、安东等地。民国38年7月，县境22艘风船参加解放长山岛的海上运输。1956年，金山港帆船社成立，有帆船7只。经营海上运输。1958年11月撤。
建国后，常有烟台、东北货船来庙江港停泊。进口货物有化肥、钢材、木材等；出口物资有食盐、酒、苹果、猪肉、面粉等，年运量万余吨。1982年，始有烟台港拖轮，常进庙江港运砂，年吞吐量36万吨。
1985年8月，宁海镇新牟里“全洲海运公司”5000吨位，4080马力远洋货轮航行于上海——广州沿途各港口。
客运 据日本纂书《山东及胶州湾》记载：清光绪六年(1880)，芝罘(烟台)、养马岛、成山港间，有小汽船二三艘，每日往返2次。据《清史稿·交通志》记载：光绪三十年(1904)，直隶省(河北省)有往来烟台、龙口、养马岛、威海卫之小轮。
民国时期，轮船日渐增多，养马岛、金山港、系山口均有汽船停泊。商旅往来，多乘汽船。时因港内水浅，上下客仍需舢舨驳运。民国19年(1930)，北山村曲宗代购置汽船1艘，载客定位30个，每日往返金山港——烟台。民国20年，养马岛黄家庄黄氏购置汽船1艘，客座定位70个，日往返养马岛——烟台。民国21年，烟台靖安公司客轮 “济安”号于烟台、养马岛、系山口之间，年往返600次。
建国后，县境短途客运船，系山口有载重2.5吨大舢舨5只；仅限岛陆海岸间，赶潮水.渡客。庙港有大舳舨8只，南北摆渡于庙江港与盐滩之间，主要用于渡客。1952年.象岛2个私营摆渡组10余只船分别往返于庙江港与盐滩、系山口与洪口之间海域，进行渡客。1958年，象岛公社摆渡队经营庙江港与盐滩间的客运，日客流量100～300人次。同时。系山口与洪口间的客渡停业。1965年，将摆渡大舢舨改为20马力机船。日客流量大增.驻岛部队机动驳船，以军需为主，兼为民义务驳运.70年代摆渡队多为人货混驳。立春后，当冰封前海时，摆渡队便破冰驳运。1979年5月，跨海大坝通车后，摆渡队停业。四、海上监理清同治四年(1865)，系山口为烟台东海关所辖的沿海口岸之一，进出口船舶货物必经检验。民国20年(1931)，系山口海关分卡，对过港船只进行监督检查，征收关税，查禁走私。1980年，县渔船渔港监督管理站根据《牟平县象岛渔港港章》进行港务监督。按照《渔业船舶船员考试规则》，对职业船员进行考核，合格者发给船员证书。对进港报关的船舶登船检查，合格者签证放行，违章者给予处理并罚金。