【赛时运行指挥体系】亚沙会指挥机构。2011年 1月，亚沙会筹办体系始由专业部门办赛向举办城市共同承办转变，海阳第三届亚沙会工作领导小组在下设办公室的基础上，增设场馆建设运行、城市建设及综合整治、交通运输保障、医疗救护与食品药品安全、内宾接待、外事外联、安全保卫和信访维稳、赛事综合保障、宣传文化和志愿者服务、赛事运行等 10个工作组。10月，全市成立亚沙会总指挥部，统筹赛事运行和城市运行。总指挥部下设办公室、亚沙村和若干个专项指挥中心，分别承担各专业领域的工作，办公室、亚沙村及各指挥中心均由一名市级领导牵头，部分指挥中心主任为组委会执行局成员。2012年 5月，建立赛时主运行中心（MOC），赛时全天候运行。
亚沙会工作团队。运行执行层包括各指挥中心下设的各工作团队，具体负责赛事运行和城市保障的组织实施。共设立 7个竞赛场地团队、10个非竞赛场地团队、若干个专项工作团队。
【场馆化】组委会根据工作需要，以场馆场地为依托，以属地政府为保障，以竞赛为导向，整合各方面资源，逐步组建各类场馆团队，并在倒计时 200天起陆续投入运行。组委会原有工作人员 245人，在场馆化过程中，大多同时兼顾原有岗位和团队新岗位的工作。2011年 12月，完全转入所属团队。亚沙会闭幕后，各自返回原所属部门，从事总结收尾工作，并分批接受赛后安置。赛会志愿者于 2012年 6月 10日全部到岗。本届亚沙会共有全职工作人员 3402名。其中，竞赛团队 305人，非竞赛团队 3097人。志愿者、政府支持人员和合同商人员共有 4700名。
竞赛场馆团队组建。包括凤翔滩 A区、凤翔滩 B区、凤翔滩 C区、凤翔滩 D区、攀岩团队、公路轮滑团队、静水团队等 7个团队。为配合 7个团队工作，组委会体育部原有领域及工作人员全部转入竞赛指挥中心。
非竞赛场馆团队组建。开闭幕式团队、主新闻中心、国际广播电视中心、运动员村团队、媒体村团队等均由组委会在负责前期筹备工作的基础上，分别由新闻宣传部、文化活动部、运动会服务部、外联部、媒体运行部为主参与，整合相关职能部门、社会力量等组建。酒店服务团队由市委办公室、政府办公室牵头组建。盛龙建国饭店团队、雅乐轩酒店团队、曦岛游艇会团队、抵离团队等均由组委会牵头，会同业主单位、属地政府联合组建。