民国期间，管辖山亭区境内的峄、滕县政府均设立建设科作为工商行政管理机构。1943年，抗日民主政府成立山东省工商总局。当时峄县、滕县属鲁中南工商分局管辖。同年9月，在山亭镇岩底村正式建立滕县工商管理支局。1945年，改为鲁南行署滕麓支局。现山亭区境内的山亭、辛召、桑村、城头、徐庄、冯卯、店子、水泉属滕麓支局，张庄、西集、北庄、半湖、傅庄、东凫山属赵峄支局。
建国后，峄县、滕县人民政府分别成立了工商科担负着本地区的工商行政管理工作。1956年，县级工商科被撤并，同年改为商业局。1957年6月，峄县、滕县分别成立了县市场管理委员会，简称“市管会”，各区乡普遍建立了市场交易管理所。1958年各基层交易管理所全部撤销由基层供销社代管。1961年，桑村、店子、山亭、冯卯、辛庄、徐庄、西集、北庄8处公社重新建立了市场交易管理所。文化大革命期间，区（县）商业科作为工商行政管理机构，取消“市管会”，保留工商局的牌子，工商管理机构名存实亡。
中共十一届三中全会后，工商管理机构逐步得到充实和加强，山亭区境内已建立9处工商所，24名工作人员。1983年11月齐村区改建为山亭区，齐村区工商局改为山亭区工商行政管理局，下设四股、两室、一所，即市管股、企业股、合同股、会统股、办公室、劳协办公室、检查所。下辖山亭、桑村、城头、徐庄、店子、辛召、冯卯、西集、东凫山、北庄、半湖、水泉12个工商所。截止到1987年底局机关38人，全系统共112人。