一、动物资源
全区由于地形复杂，山林较多，因而野生动物较多。兽类有四目：食肉、食虫、啮齿、翼手，五科：犬、獾、猫、猥、兔。鸟类有七目：雀形、鴷形、号形、鸡形、鸽形、鹤形、鹬，十五科：鸦、黄莺、卷尾、燕、文鹟、山雀、惊鸟、百灵、啄、鸱鸮、隼形、鹰、雉、鸠鸽、鹬雁。鱼类有四目：鲤形、合鳃、鲈形、刺鳅。十科：鲤、鳅、鲶、鳢、鲩、合鳃、鳍科、攀鲈、虾虎皮、刺鳅。其它类型有：青蛙、蟾蜍、甲鱼、蜥蜴、壁虎、蛇、蜘蛛、蝎子、蜈蚣（蚰蜒）、马陆、螃蟹、虾、蚂蝗、蚯蚓、蜗牛、钉螺、河蚌等。
二、植物资源
由于境内地貌类型多，植物资源极其丰富，门类科属繁多。木本植物，据1985年山东农业大学林学系在山亭区的调查，木本植物共56科，123属，191种。
草本植物有35科77属：35科包括：桑、蓼、马兜铃、藜、苋、马齿苋、石竹、毛莨、十字花、紫井天、蒺藜、豆、远志、大戟、葡萄、施花、紫草、唇形、茄科、蓄参、车前、茜草、忍冬、葫芦、桔梗、菊、三棱、乔木、莎塘、天星、浮萍、鸭拓草、百合、卷柏、睡莲等。76属包括草葎、蓼、酸模、马兜铃、地肤、猪茅菜、苋、青箱、齿苋、石竹、王不留、铁鲜连、白头翁、毛莨、播狼嵩、瓦松、蔡藜、米口袋、黄芪、远志、铁苋菜、爬山虎、大戟、葡萄、紫藤、熏菜、柴胡、蛇床、防风、兔丝子、牵牛、打蜿、附地菜、筋骨草、益母草、荆芥、陀螺、酸浆、毛黄、阴行草、车前、茜草、忍冬、括楼、沙参、党参、桔梗、嵩、刺菜、向日葵、菊、刺头、漏芦、苦实菜、鬼针、蒲公英、苍耳、三棱、画眉草、白菜、芒、狗尾巴草、燕麦、管草、莎草、半夏、鹿草、鸦拓草、葱、宜草、百合、黄精、绵枣、卷柏、莲、芦苇。