清朝末年，境内北8乡镇、南6乡镇的农业分别归滕、峄两县的“劝业所”管理。建国前夕，属滕、峄两县的建设科管理。50年代分别由滕、峄两县农业科按辖区管理。1962年6月之前，分别由滕县农业局、枣庄市农业局管理。1962年6月建立齐村区，1962年6月至1983年10月，北8乡镇和南6乡镇分别由滕县农业局、齐村区农业局管理，直至1983年11月组建山亭区后这块土地上才有独立的农业管理机构——山亭区农业局。1984年5月，山亭区农业局改称为山亭区农牧渔业局。
1962年6月，枣庄市委决定设立齐村区，7月组建了齐村区农业科。农业科下设办公室、农业技术推广站、会计辅导站、林业站和水利组，共有人员33人，其中大专文化程度5人，中专文化程度10人。1963年3月，齐村区改名为齐村办事处，齐村区农业科也随之改名为齐村办事处农业科。1968年5月，全区的农业生产由区革命委员会生产组负责。1970年4月，齐村区革委核心领导小组决定，设立两部一室，即齐村区革命委员会政治部、生产指挥部。生产指挥部下设农业组，农业组管理农技站、会计辅导站、林业站、水利站等单位，全组共有27人，其中大专文化程度4人，中专毕业生11人。1972年9月，农业组组建为农林水电局，除管辖农技、会计辅导、林业、水利四站外，另有农机管理站、拖拉机修配厂、西集果园、半湖良种场及齐村供电站也交给了农林水电局管理。是年10月又建立了局属下的区畜牧兽医站，1973年3月建立了种子站。
1975年9月，农林水电局分为农林、水电两局。农技、会计辅导、林业、种子、水产、畜牧兽医、农机等站和西集果园、半湖良种场、拖拉机修配厂隶属农林局。全局共有46人，其中大专文化程度8人，中专文化程度20人。1983年6月22日撤销齐村区农林局，分别建立齐村区农业局、齐村区林业局，隶属于区农委领导。
1983年11月，组建山亭区，齐村区农业局更名为山亭区农业局。1984年5月，山亭区农业局改称为山亭区农牧渔业局，下辖办公室、农技站、经管站、植保站、种子站、土肥站、水产站、畜牧兽医站、农广校办公室、西集果园等。全局编制人员共54人，其中大专文化程度4人，中专文化程度31人。至1987年底，山亭区农牧渔业局机构设置没有变。