1905年，美国基督教会派来传教士叶克思牧师、文牧师、华牧师、唐牧师等人在峄县设立了南关基督教会。总会下设峄北支会(枣庄)，峄阳支会(台儿庄)，峄东支会(今苍山县兰陵镇)，峄西支会(金陵寺乡高皇庙村)，运南支会(涧头集)，运北支会(今微山县多义沟村)。每个支会又下设2至4个分会。总会在南关设立教堂，分会也有活动场所。建国前，峄县信仰基督教的达10000多人。
峄县南关基督教总会和各个支会都办了教会学校。在峄县南关设有实业中学，校址占地200亩，有师生300多人。学生一面劳动，一面学习，并进行宗教活动。南关还设有灵光道院，都是女学生，有师生100余人，校长是美国人，名叫范珍珠。教师李恩惠、任士美都是美国人。
峄县南关教会还设了“瑞美德医院”，院长是美籍德国人孔宁汉。医院占地30多亩，有楼5座，产房13间。
在峄县南关建立“孤儿院”，美籍德国人万美利任院长，1936年从临沂迁来。该院有房子100间，孤儿300多人。万美利在台儿庄设立了医院，在枣庄办了牛奶厂，在周营开了酱园店，在临沂设了盐厂，在峄城南小湾村占有耕地300余亩。万美利于1953年回国。
1949年后，人民政府贯彻了宗教信仰自由的政策，在基督教中开展了自治、自养、自传的“三自”爱国运动。割断同外国的联系，废除了教会的土地私有制，没收了教会的附属财产，合理的安排了宗教活动场所，使该教摆脱了帝国主义控制，走上了爱国的道路。文化大革命期间，教堂被关闭，宗教活动转入了“地下”。教会以家庭方式，进行隐蔽活动，形成了放任自流状态。1980年后，人民政府通过贯彻落实民族宗教政策，基督教又公开进行活动，开展了“三自”爱国运动。
信仰基督教的人绝大多数是老年人、妇女或病人。他们以念经、祈祷、忏悔、礼拜等方式从事宗教活动。
峄城南关教堂是枣庄市最大的教堂。建于1912年，西洋式结构，建筑面积460平方米，美国基督教会所建。1985年，国家拨款10万元进行了整修。现为鲁南较大的宗教建筑之一。截止至1990年底，峄城区基督教活动场所有两处，峄城南关、阴平镇下郭家村。