一、水域资源
峄城区南部河渠较多，中部平原多有一些自然坑塘，北部山区兴修了一批水库、塘坝，对水产业的发展提供了一定的水域资源。据1982年调查，全区水域面积7418.2亩，占全区总面积的0.78％。在各类水面中，河道沟渠占32.6％，水库塘坝占24.3％，坑塘占43.1％。可养鱼总面积为3333.9亩，占总水面的44.9％，后经加工改造，面积略有增加。
本区光照充足，气候温和，水温≥15°C以上的时间在6个月以上，适宜多种鱼类生长。从水质情况看，库塘及坑塘水体负载能力较大，多为富营养型；而不少河道因污染严重，再加上多为季节性泄洪河道，水位极不稳定，故很难开发利用。
二、渔业资源
本区鱼类共有7目、15科、39属、54种。主要养殖品种有草、鲢、鳙、鲤、鲫、鳊、鲂、白鲫、罗非鱼等。
其它渔业资源有虾、蟹、鳝、鳗、鳖等。本区虾类有淡水青虾、小长臂虾、中华新米虾，沼虾，库塘、沟渠、河溪中均有生长，自然捕捞年产量可达万余斤。本区南部运河及其支流，甲鱼(鳖)资源较丰富，近些年因滥捕和生态环境恶化，数量锐减，个体变小，已形不成产量。
三、铒料生物资源
水生植物
水生植物是草食性和杂食性鱼类的重要铒料。本区有2门、29科、38属、53种，多为自然生长。人工栽培的主要有藕、苇、蒲。藕一般在坑塘或沟渠内栽培，历史悠久，但面积不大，1956年全县仅35亩，1972年全区扩种至309亩，至1990年达到430亩，亩产1400公斤左右，总产60万公斤，再加上莲子、干菏叶，亩收入在1500元左右。芦苇分布于河沟及多年积水的沼泽地，建国前多自然繁衍，建国后始人工栽植，1962年全区仅60亩左右，1972年发展到400亩，总产18万公斤，1990年面积仍未扩大，但产量增至30万公斤。蒲草原为野生，1980年后人工栽植，面积15亩。
底栖动物
本区底栖动物种类较多，南部河渠主要以软体动物中的蚌螺类为主，北部库塘中以寡毛类和昆虫类幼虫为多。这些底栖动物，不少是杂食性鱼类的铒料，有的亦可供人们食用，有的蚌类还可生产珍珠，或加工成工艺品。
浮游生物
本区各水域浮游生物种多量大，是鱼类的重要铒料来源。浮游植物主要是藻类，如小环藻、菱形藻、衣藻、舟形藻、盘星藻、星球藻、小球藻、纤维藻、鱼腥藻等十余种。旺季每升水体含量达数千万个，大部分可为鱼类消化利用。
浮游动物的优势种为沙壳虫、多枝轮虫、刺胞虫、太阳虫等，每升水体含量多达数千至数万个，也多为鱼类的重要铒料。