峄城区水资源丰富，人均占有量高于全省、全市，通过合理开发，可满足工农业生产和生活需要。
一、河系
峄城区河流属淮河流域韩庄运河以北支流系统，以峄城大沙河为界，河西属南四湖湖东地区，河东属邳苍地区。地面径流总的方向是由北向南。在本区境内形成的主要河流有新沟河、四支沟、三支沟和阴平沙河。峄城沙河是本区过境的最大河流，发源于山亭区的半湖和市中区的税郭一带，南北纵贯本区宛转而下，在台儿庄境内入运。流经并在区境内入运的河流有二支沟(也叫周营沙河)和一支沟。边界河流一是韩庄运河，从西向东沿本区西南的曹庄、坊上、古邵三乡(镇)的南部边沿，经台儿庄至江苏邳县；二是陶沟河，发源于苍山县糖稀湖一带，沿本区与苍山县边界进入台儿庄区境内。其次，山溪性小河，还有属峄城沙河的棠荫支流，属新沟河王场支流的城东截水沟、左庄河、峨山河、河湾排水沟、拉子沟等。
二、地表水
峄城区每年平均径流量为1.795亿立方米。但因降水变率大和拦蓄能力差，因而径流量季节变化很大。7、8、9月份径流量即达1.027亿立方米，占全年径流量的57.2％，其中7月份的径流量为4581万立方米，占全年径流量的四分之一。除本区地表径流外，全区年入境客水多年平均总量达近3亿立方米，为境内径流量的1.67倍，也是十分重要的地表水资源。
三、地下水
地下水的主要来源是降水补给，其次是地表水体补给。地下水流方向，棠荫盆地是北、南、西三面向盆地的中部汇流，然后又转向东南方向流动。其余各区水流方向多数都是由北向南。
地下水埋深，年际变化较大，季节变化也较大。地下水位从6月中旬开始回升，7月中旬至8月中旬达到高峰，11月份开始下降，到翌年4至5月下降到最底点。本区地下水总储量为17495.7万立方米，多年平均地下水总补给量为13322万立方米，净补给量(年可开采量)为9006万立方米。
四、山泉
峄城区共有常年流水泉28处，其中二类泉(自然流量1000-10000吨/日)4处；三类泉(自然流量1000吨/日以下)24处，分布及出露多在山丘低洼处。据成因有上升泉和下降泉之分。在乡(镇)分布上，棠荫乡最多，17处，阴平镇4处。
峄城区山泉一览表
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│编│类│泉名 │位置 │类型│出水量 │测试 │自流时间 │
│号│别│ │ │ │米3/日 │日期 │ │
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│1 │2 │后兴集泉 │古邵乡后兴集村中河底 │上升│ │ │ │
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│2 │3 │上屯泉 │阴平镇上屯村北700米山坡 │上升│288 │1981年 │全年 │
│ │ │ │ │ │ │9月15日 │ │
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│3 │3 │兵房镇泉 │肖桥乡兵房镇村西南750米 │下降│ │9月18日 │全年 │
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│4 │2 │斜屋泉 │阴平镇斜屋村东400米 │上升│4320 │9月16日 │全年 │
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│5 │3 │斜屋泉 │阴平镇斜屋村东南150米 │上升│1200 │9月16日 │全年 │
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│6 │3 │董泉 │阴平镇斜屋西北500米 │下降│240 │9月20日 │全年 │
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│7 │3 │东关山口泉│棠荫乡东关山口村北700米 │上升│480 │9月22日 │全年 │
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│8 │3 │陈村泉 │棠荫乡陈村东北500米 │上升│120 │9月22日 │全年 │
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│9 │3 │陈村泉 │棠荫乡陈村东南600米 │ │24 │ │ │
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│10│3 │南龙塘泉 │棠荫乡南龙塘村东南600米 │上升│24 │9月25日 │全年 │
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│11│3 │朱村泉 │棠荫乡朱村北700米 │下降│24 │9月25日 │全年 │
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│12│3 │贾泉 │棠荫乡贾泉村北50米 │下降│1920 │9月26日 │全年 │
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│13│3 │逍遥村泉 │棠荫乡逍遥村西2500米 │上升│24 │9月27日 │全年 │
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│14│3 │郭庄泉 │棠荫乡郭村村内 │上升│24 │9月27日 │全年 │
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│15│2 │闫村泉 │棠荫乡闫村南300米 │下降│1200 │9月27日 │全年 │
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│16│3 │马山套泉 │棠荫乡马山套村西北200米 │下降│360 │9月27日 │全年 │
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│17│3 │黑峪泉 │棠荫乡黑峪村北1500米 │ │ │ │ │
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│18│3 │北山口泉 │棠荫乡北龙塘村西20米 │上升│240 │9月30日 │全年 │
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│19│3 │北山口泉 │棠荫乡北龙塘村东20米 │上升│144 │9月30日 │自流十个月│
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│20│3 │北山口泉 │棠荫乡北龙塘村水库内 │上升│ │9月30日 │全年 │
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│21│3 │娘娘坟泉 │棠荫乡娘娘坟村西10米 │上升│360 │9月30日 │全年 │
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│22│3 │牛山后泉 │棠荫乡牛山后村西南500米 │上升│360 │10月1日 │全年 │
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│23│3 │黄泉 │萝藤乡黄泉村内 │上升│480 │10月16日│全年 │
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│24│3 │后利增泉 │萝藤乡后利增村西50米 │上升│360 │10月16日│全年 │
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│25│3 │邱庄泉 │底阁镇邱庄村西10米 │上升│不清 │10月18日│全年 │
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│26│3 │大泉 │王庄乡南刘庄村南泉山北麓│ │ │ │ │
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│27│3 │青檀寺泉 │王庄乡青檀寺庙院内 │ │ │ │ │
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│28│3 │七泉子 │棠荫乡小庄子村北1200米 │ │27.8 │ │ │
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