医护工作制度1955年10月，县医院建立医护工作制度，各区卫生所参照执行。之后，逐年完善。"文化大革命"中，各项制度遭破坏。1978年贯彻卫生部《医院工作人员职责试行草案》，使医护工作制度更加健全。1990年起，各医疗单位推行岗位责任制和经营管理。
公费医疗制度新中国建立前，国家干部用药采取记帐的办法，由县政府统一结算。1953年，公费医疗列入国家财政预算，由县卫生科统一管理。1964年，沂源县人民委员会制发《沂源县公费医疗管理试行细则》，成立公费医疗管理委员会，规定享受对象和开支范围，管理严谨。1980年实行经费包干制，公费医疗由卫生局设专人管理。1987年，公费医疗由县卫生局、财政局共同管理，并成立公费医疗办公室，发证到人，从严管理。由于享受公费医疗人数逐年增加，药价上涨，公费医疗费用连年超支。1988年，公费医疗6950人，支出74.30万元，人均105元，超支33万元。1990年公费医疗7210人，支出130万元，人均180元，超支80万元。
合作医疗制度1969年5月， 农村兴办合作医疗。至1970年底，办合作医疗的生产大队有130个，1975年底，增至519个，占全县生产大队总数的78.2％。医疗资金由生产大队和社员共同负担。 社员每人每年交1-2元不等，生产大队从公益金和副业收入中提取一部分作为医疗费补助， 社员凭证免费就医。1978年，按照山东省《农村合作医疗管理章程(试行草案) 》，全县有8处公社，实行社队联合的合作医疗。生产大队将筹集的医疗费交本公社医院代管，社员凭大队介绍免费到院就诊。1982年，农村落实生产责任制,合作医疗大多停办。1990年底，只有4个村实行合作医疗。