民国时期菏泽专署设建设科，管理水利事务。1947-1949年，冀鲁豫行政公署设
交通处，兼管水利工作。1949年10月，菏泽专员公署组建水利科。1950年3月，水利
科撤销并入建设科。1955年3月从建设科分出另设水利科。1958年1月，菏泽地委决定
将菏泽专署水利科改建为山东省菏泽专员公署水利局。4月，水利局撤销。6月，成立
山东省菏泽专区水利建设指挥部，是年11月，菏泽、济宁两专区合并，并入济宁专署
水利建设指挥部。1959年6月恢复菏泽专区，重建菏泽专署水利建设指挥部。1968年
2月又改为菏泽地区水利建设指挥部革命委员会。是年10月，水利建设指挥部与黄河
修防处、水文站、农电所合并为菏泽地区人民水电服务站革命委员会。1969年12月复
改为菏泽地区水利建设指挥部革命委员会。1970年2月，又改为菏泽地区水利建设指
挥部。1977年7月，水利建设指挥部撤销，组建农林水办公室。1980年2月，农林水办
公室撤销，成立菏泽地区行署水利局，6月改名为菏泽地区水利局至今。