菏泽植物资源丰富，适于多类农作物栽培。农作物栽培有禾本科、豆科、锦
葵科、旋花科等作物，共23类，568个品种。主要有小麦、玉米、大豆、水稻、
花生和棉花，其中棉花、大豆总产量居全省之首。
蔬菜、瓜类品种繁多，是全国著名的“西瓜之乡”。市内林果属暖温带落叶
阔叶林，多为人工栽培，树木有51个科，106个属，228个品种。
菏泽是全国第四个、全省第一个平原绿化达标市；林木总蓄积量2228万立
方米，是全国农区最大的经济林基地。
菏泽市是全国闻名的中药材生产基地，其中有名的药材有丹皮、半夏、地黄、
天麻和木瓜等14种。
水生植物主要有苇、藕、蒲草等。
菏泽动物资源中牛、羊是强项，青山羊的饲养量居全国农区第一位，居全省
之首。菏泽是国家确立的牛、羊出口基地，鲁西大黄牛、小尾寒羊、青山羊被称
为三大“国宝”。
水生动物主要有鱼、虾和甲鱼。