其杂交方式有两种：定向培育和多父本混合授粉。
(1) 定向培育：为培育出花色花型奇异的新品种，有目的地选择父本和母本进行
人工辅助授粉，培育出人们理想的新品种。首先选好母本，在花蕾第二天就要开放，
而花药尚未成熟时进行。先去除雄蕊。用手轻轻分开花瓣，再用镊子将雄蕊全部摘除
不要碰伤柱头。去雄后立即套上硫酸纸袋，以防其他花粉传入。在母本去雄的前一天，
还要从父本的植株上选择第二天就能开放的花蕾，套上硫酸纸袋，防止花蕾开放后其
他花粉混入，致使父本花粉不纯，起不到定向授粉的作用。
牡丹花粉在花开的当天上午9—12时生命力最强。如果把花粉摘下存放在阴凉处，
可以生活3—5天，但生命力会逐渐减退。雌蕊柱头的生命力较强，一般5—7天内皆有
受粉能力。
授粉的最好时间是采粉当天的上午9—12时进行。 先把父本花蕾上的套袋取下，
视其花药成熟情况，如花药已破裂散粉，便可采下，放入采粉盘内；再将母本花蕾上
的套袋取下，如柱头已分泌出粘液，便可进行授粉。用新毛笔蘸取父本的花粉，轻轻
涂在母本柱头上，授完粉后要套上纸袋，避免其他花粉串杂。每授完一个组合，就要
把授粉用具在70％的酒精里浸一下，以杀死粘附的花粉，然后再进行下一个组合。授
粉过程结束后还要在授粉的母株上做好标记，注明父、母本品种名称和授粉日期。为
确保成功，可采取多次授粉法，因雌蕊生命力强，可连续授粉2—3次。恶劣气候条件
下不要实施授粉。 授粉8—10天后，柱头已停止分泌粘液，可取下纸袋，待种子成熟
后，单收单放，并建立档案。
(2) 多父本混合授粉：用两个以上父本的花粉做父本，跟一个母本授粉。菏泽多
采用此法，好处是简单易行，不需套袋和作标记，花粉可混采混授，授粉率高，可大
面积应用，是扩大新品种来源的主要办法。这种方法的优点是种多、苗多、变异多，
选种机会多，缺点是选出的优良品种不知道父本，淘汰的也多。