1987年10月1日，威海商检局承接了部分进出口商品的检验、鉴定和监督管理业务。至年底，商检局共完成进出境船只检验鉴定35艘次，检验进出口商品37批次，货物总值64万美元。1988年8月15日后，业务工作全面铺开，检验进出口商品1967批次，货值10102万美元。1990年，检验进出口商品7088批次，货物总值22367万美元。1999年检验进出口商品18913批次，货物总值46755万美元。到1999年11月6日机构撤并时止，威海商检局共检验进出口商品148134批次，货物总值454470万美元。2000年后，由国检局承担出入境检验检疫工作。2002年，检验检疫进出口商品33059批次，货物总值99700万美元。
一、进出口商品检验
1987年，经威海商检局检验的进口商品16批，货物总值25万美元，主要是进口机电仪表类商品，出具索赔证书1份，对外索赔2万美元。1990年，检验进口商品192批，货物总值8060万美元，主要是进口木材和设备，并新开验了进口成套设备、机动车辆和塑料原料等，发现不合格商品14批，索赔金额74万美元。1999年，检验进口商品960批，货物总值6134万美元，主要是进口机电设备、橡胶、塑料原料、石油等。发现不合格商品18批，索赔金额132万美元。到机构撤并时止，威海商检局共检验进口商品13228批次，货物总值129637万美元，发现不合格商品245批，索赔金额2430万美元。2000年，检验检疫入境货物2412批，货值10390万美元，发现不合格出入境货物14批，货值121万美元。2002年，检验检疫入境商品4659批次，货物总值27100万美元，发现不合格入境货物56批。
威海商检局的出口检验业务1987年为21批，以轻化工产品、纺织服装、机电仪表、水产品及粮油食品为主。1988年，为1799批，种类有纺织品、服装、鞋类、轻工机械、电机、冷冻食品、水果、罐头、粮谷等，检验货物总值4319万美元，共有46批不合格产品被禁止出口。1990年，检验出口商品6896批次，货物总值14307万美元，检验范围包括15大类113个品种，大宗商品以水产品、服装为主，新开验出口轮胎、抽纱制品、玩具、机床附件、钟表、毛针织品、五金工具、鞋类、锁、纺织丝绸、花生制品等47种商品，发现不合格商品70批。1999年,检验出口商品17953批次，货物总值40621万美元，主要品种有水产品、花生及制品、服装、抽纱品、轮胎、果汁、玩具、传真机、显示器等，发现不合格商品64批。2000年,检验检疫出境货物25239批，货值57132万美元，检出不合格货物87批，货值158万美元。2002年,检验出境货物28400批次，货物总值72600万美元，发现不合格出境货物77批。
二、进出口商品鉴定
主要业务有进出口商品的重量鉴定或数量鉴定；出口货物运载工具的船舶检验；装载出口货物船舶船舱的监视封舱；装运进出口货物的集装箱的拆、装箱鉴定。1987年，完成10艘次船舶的验舱、水尺计重、容量计重、衡器计重的鉴定。1990年，完成51艘次出入境船舶的检验鉴定。1999年，完成52艘次出入境船舶的检验鉴定工作，并对758个标准集装箱的出口验箱和858个标准集装箱的进口拆箱进行了鉴定。
从1993年开始，威海商检局对外商投资财产进行价值鉴定，当年鉴定了43批，经鉴定降值106万美元。1995年鉴定70批，共降值102万美元。1999年鉴定91批，降值71万美元。到机构合并时为止，共进行外商投资财产价值鉴定479批，经鉴定降值814万美元。2002年，检疫监管出入境船舶755艘，水尺、容量计重15批次，货重137500吨；出境检舱29批次；检疫监管出入境集装箱68800标箱。
三、监督管理
监督管理业务主要是对重要的进出口商品及其生产企业实行质量许可制度，根据企业的申请办理普遍优惠制产地证明书和一般产地证明书。1988年，对35个出口水产品加工厂、库进行了考核注册和到期复查；对34个纺织品、服装类商品生产企业进行了考查认证。至同年底，连同山东商检局和烟台商检局注册、认证的企业，威海市共有51家水产品冷藏加工厂库、2家罐头厂、4家肉类加工厂和3家酒类企业获得出口食品卫生注册，20家服装厂、10家纺织企业、4家抽纱工艺品生产企业、6家木工机械厂及工具、量具、陶瓷、锁类厂等44个企业获得出口商品质量许可证，并全部纳入全国统一编号。1990年，威海市共有68家水产品加工厂库、2家罐头厂、5家肉类厂、4家酒类厂共79家企业获得出口食品卫生注册；有22家服装厂、10家纺织厂、4家抽纱工艺品厂、8家木工机床厂、2家工具厂、1家量具厂、1家陶瓷厂、1家锁厂共49家企业获得出口商品质量许可证。后国家取消了对服装的质量许可制度，但注册认证企业数仍逐年增加，到1998年，有136家企业获得出口食品卫生注册，60家企业获得出口商品质量许可证，对157家企业实行了登记管理。其中，有16家出口食品企业获得国外多项注册认证，包括获得美国HACCP认证企业9家、日本注册企业7家、欧盟注册认证7家。同时，全市出口企业推广ISO9000国际质量体系标准认证也迅速增加，同年底，全市共有认证企业33家。2002年，威海国检局在56个企业实施了过程监督检验模式，加快了出口产品的检放速度，有139个企业开通了直通式电子报检。
1989年，威海商检局承接了普惠制产地证签证业务，是年签证13份。1995年，全市有普惠制产地证注册企业330家，全年签发普惠制证书2867份，签证金额9095万美元。1999年，签证6117份，签证金额14186万美元。至2002年，共签发普惠证书35593份，签证金额8.98亿美元。
四、动植物检疫
1987年，开始正式承担检疫任务，当时只检疫进口木材。从1990年9月16日威海—仁川通航后，威海动植物检疫工作全面展开。至2002年，进境检疫主要货种有木材、苗木、蔬菜种子、香菇菌种、皮革等；出境检疫主要货种有苹果、花生粕、橡子仁、植物性中药材、玉米、豆粕、鲅鱼、乌龟、百灵鸟、蛇、狗、蜜蜂、蜈蚣、贝蛤、活虾、活海鳗、明太鱼、羊毛、鸭绒、猪皮、活泥鳅鱼、活贝、蚕蛹、冷冻蚕蛹、鲜猪皮、牛皮等。是年，在入境木材和货物木制包装中检出活体有害线虫45批，均按规定做退回、销毁或熏蒸处理；在入境船舶上截获偶蹄类动物肉类28批次，其它动植物及其产品20批次。
五、卫生监督
1987～1999年，监督和指导有关单位和人员对啮齿动物、病媒昆虫的防除；查验食品、饮用水及其储存、供应、运输设施；监督从事食品、饮用水供应的从业人员健康状况，检查其健康证明书；监督和检查垃圾、废物、污水、粪便、压舱水的处理达1672人次。船舶监督2671艘次，签收船舶除鼠/免予除鼠证书443份。船舶卫生检查签收交通工具卫生证书88份。1998年6～8月，对威海港蝇类种群组成及密度情况进行调查。其结果：共有蝇类4科11属14种；以丝光绿蝇为主，占40.84%；棕尾别麻蝇和中华海花蝇次之，分别为18.48%和11.84%，平均密度92只/笼/类。2000年4月，对威海口岸蚊类进行调查，经对捕获蚊类进行鉴定，共有2属10种。库蚊属：贪食库蚊、二带喙库蚊、三带喙库蚊、淡色库蚊、幼小库蚊、胸库蚊、致倦库蚊、幼小库蚊、白胸库蚊；按蚊属：中华按蚊。是年，检疫查验出入境旅客140073人次，共截获入境非法携带物品30批次，对96批出入境货物进行了卫生除害处理；检疫监管集装箱40245标准箱，鉴定集装箱589标箱，计重31批，货重11.6万吨;检疫查验出入境船舶691艘次;健康体检7460人，其中出境人员6609人，入境人员851人;查出澳抗阳性234人，其中20人为乙型肝炎活动期。预防接种7036人次，其中接种霍乱疫苗6904人次，接种黄热疫苗132人次。2002年，出入境人员监测体检1.14万人；其中，查出性病患者2例，肺结核患者3例，澳抗阳性208人，肝炎患者55例。