建区后，经区城中河道由经区市政部门统一规划和整治改造，2009年移交市水务集团管理。
九龙河（原名徐家河）
区内一条贯穿南北的长河，全长16.8公里，流域面积37平方公里。1994年完成珠海路到深圳路段河道改造，2000年完成入海口至大庆路段下游河道改造，2005年完成大庆路至齐鲁大道段河道改造，2006年完成九龙河中游河道整治改造，2007年完成上游河道及部分支流河道整治改造。
渤海河
位于华夏路中间，自环山路西侧向东入海，全长4.2公里，流域面积4.2平方公里。1994年以后陆续进行改造，2000年完成青岛路以东河道改造，2005年完成青岛路以西河道改造。
海峰河
原名长峰河，自北葛拉村向东入海，全长7公里，流域面积8.5平方公里。1994年完成青岛路以东河道及入海口改造，2008年完成青岛路至环山路段河道改造。
蒿泊河
九龙河支流，自岳家庄村向东汇流入九龙河，全长4.5公里。1993年3月对下游河流进行改道整治，改道后的河流与齐鲁大道平行，2007年完成青岛路至九龙河段河道改造。
天东河
九龙河支流，自南葛拉村向东汇流入九龙河，全长7公里。1993～1994年完成青岛路以东河道改造，2006年完成青岛路至环山段河道改造，2007年完成环山路至徐家疃段河道改造。
曲阜河
九龙河支流，自西山口村向东汇流入九龙河，全长4公里。2002年完成青岛路以东河道改造，2007年完成青岛路至博通路段河道改造。
凤林河
九龙河支流，自凤林村向西汇流入九龙河，全长2.2公里。2004年完成香港路以西至珠海河桥段河道改造，2007年完成香港路以上河段河道改造。
2009～2010年，市水务集团先后对海峰河、渤海河、九龙河及其支流河道进行综合治理，沿河铺设污水主管道35公里，并网排污口678个，清理淤泥42万立方米，清淤河道34公里，种植各类水生植物3000余株，沿河绿化面积达5000余平方米。