机构
1992年8月，设立经区财政税务局，正县级。1993年3月，增挂国有资产管理局牌子。1994年9月，根据国务院分税制财政体制改革要求，撤销财政税务局，设立财政局、地方税务局，为一个机构两块牌子。1998年8月，地方税务局实行省级垂直管理，财政机构与地方税务机构脱钩，独立设置。2001年2月，财政局不再挂国有资产管理局牌子。
财务管理
1992～1997年，行政事业单位财务由财政部门监督、指导、定期检查。1998年9月，经区管委改革行政事业单位财务管理体制，实施“会计委派”制度，将区直行政事业单位的会计人员编制划入财政局，实行统一管理，会计实行委派，原则上两年轮换一次。1999年1月，管委10个直属部门和蒿泊街道实施会计委派。2001年4月，进行首轮轮岗。2005年10月，实行国库集中支付和会计集中核算改革，撤销所有行政事业单位会计岗位，设立国库集中支付中心，行政事业单位实行报账制。2006年，全区34个预算单位实行集中支付。2007年，38个预算单位实行集中支付。至2008年1月，除教育系统实行单独会计核算外，全区53个预算单位实行国库集中支付，35个预算单位实现会计集中核算，在威海市率先完成国库集中支付改革。2007～2010年，累计完成国库集中支付19.17亿元，其中，直接支付17.3亿元，授权支付1.87亿元。
基金管理
1992～1997年，基金由各职能部门征缴和管理。1998年1月，企业职工基本养老保险、机关事业单位工作人员养老保险、城镇职工基本医疗保险、失业保险、生育保险、工伤保险实行财政专户和收支两条线管理，建立社会保险基金月报制度。同年12月，建立单独的社会保障资金财政专户。2000年，基金改为联合集中征缴，实行“一个地点办公、一站式服务、一张支票收费、一张收据对外”。同年，保险基金财政专户收入比上年度平均增长22.2%，其中失业保险幅度达59.6%。2003年1月，机关事业单位工作人员养老保险由“全市统筹”改为“分市区统筹”，各市（区）可根据自己的实际收支情况，按以收定支、略有结余的原则，适当调整缴纳比例。年内，实行新型农村合作医疗制度。2007年，实行城镇居民医疗保险制度，将不属于城镇职工基本医疗保险制度覆盖范围的本市非从业城镇居民全部纳入保险范围，实行市级统筹。2006年起，机关事业单位工作人员养老保险基金出现当年收入金额少于支出情况。至2009年，机关事业单位工作人员养老保险存款基金缺口累计达273万元。企业职工基本养老保险、城镇职工基本医疗保险、失业保险、生育保险、工伤保险的财政专户存款分别为65386万元、6851万元、2207万元、301万元、1114万元，财政专户存款占各项基金滚存结余的比重均为100%。2010年，城镇职工基本医疗保险、失业保险、生育保险、工伤保险上缴市财政局，纳入市级统筹管理。机关事业单位工作人员养老保险存款收不抵支，基金缺口累计达459万元，企业职工基本养老保险财政专户存款84796万元。
会计管理
专业职称考试 1995年3月，会计专业职称考试由经区会计师事务所管理。1999年7月，移交经区财政局会计事务管理所管理，当年组织会计专业职称考试报名163人，其中初级102人、中级61人。2000年5月，按照国家规定将会计专业职称考试业务移交经区人事劳动局人才流动服务中心管理。2010年11月，会计专业职称考试业务由人事劳动局移交财政局管理，会计专业职称考试实行网上报名现场确认，当年共确认报考人员271人，其中，中级107人、初级164人。
从业人员资格证管理 1994年，建立会计人员手工档案，当年颁发会计证521本。2002年，建立会计从业资格信息数据库，为2350名财会人员颁发新版资格证书。2006年开始，实施IC卡会计从业资格证书，将全区3404名会计从业人员数据纳入省数据库，实现网络化管理。至2010年末，全区纳入省数据库会计从业人员4068人。
会计培训 2000年，经区财政局组织开展全区会计继续教育培训，当年举办会计法培训班14期，培训人员1200人，举办会计电算化培训班5期，培训人员96人。2009年，同时开展网络继续教育，会计人员可自行选择继续教育方式。至2010年末，共举办会计法、会计准则、税法及内部控制等继续教育培训班79期，累计培训9480人次，参加网络继续教育1055人次。
财政投资评审管理
经区成立时，管委投资工程较少，工程结算评审由财政税务局负责。随着开发区城市建设步伐加快，基础设施投入大量增加，管委投资工程逐年增多，工程审计量不断增大。1994年4月，管委批准设立经区工程预算公司，隶属财政税务局，主要负责管委投资的基础设施建设项目监督管理、工程造价监控和造价咨询工作。2001年，按建设部要求，工程预算公司实行股份制改革，与财政局脱钩。管委投资工程造价管理和工程资金管理工作由财政局预算外科负责，工程结算审计由财政局委托社会审价中介机构负责。2006年6月，设立经区财政投资评审中心，负责管委投资工程造价及资金管理，管委投资园林绿化、市政基础设施维护费用及环卫作业费用的核定，参与管委各种拆迁项目补偿费用的审定工作。2007年10月,经区财政投资评审中心更名为经区财政投资评审办公室。2007～2010年，参与公开招标224项，中标额3.45亿元；审核工程设计合同、测绘合同、监理合同175项，审核确定费用3318万元，节约资金1735万元；组织完成工程结算审核636项，提报结算价值5.41亿元，定案价值4.57亿元，节省财政支出8233万元。
财政监督
1992年10月至2007年7月，财政监督职能设在财政局企业财务科。1994年以前，主要负责组织税务、审计部门开展每年一次的企业财务税收及行政事业单位财务、资金运用情况财税大检查。1998年，国家取消每年一度的财税大检查，财务监督检查的重点转到加强日常监督检查上来。2007年8月，设立财政监督管理办公室，履行加强财政预算资金管理、加强会计行为和会计信息质量的监督职能。至2010年，组织开展“三农”和民生项目支出专项检查50余项；组织企业税收专项检查2次，检查企业80余户，查补税款5000余万元；组织开展全区行政事业单位“小金库”治理专项检查2次。