区内有主要河流4条，分别为石家河、五渚河、逍遥河、九龙河。
石家河
全长28公里，流域面积204.2平方公里，区内干流长度14公里，流域面积20.4平方公里。发源于文登邓南村，流经区内圈邓家、白马西、白马南、白马北、刘官屯、河北吴家、屯钟家、小邓格、小林格、大林格、夏庄、泊于家，在泊于镇蒲湾村入海。上游刘官屯河道宽80米，下游泊于家河道宽180米。
五渚河
全长24.5公里，流域面积108平方公里，区内干流长度4.75公里，流域面积6平方公里。发源于环翠区温泉镇周立顶，流经区内中村、西村、岭西、河东、东、刘家滩、张家滩，在崮山镇卫家滩入海。上游中村河道宽55米，下游卫家滩河道宽110米。
逍遥河
全长9.27公里，流域面积28平方公里，区内干流长度8.25公里，流域面积12.54平方公里。发源于环翠区温泉镇佛爷顶，流经区内松郭家、金鸡、赵庄、逍遥、圈于家、盐滩、鲍家，在泊于镇岛邓家村东北入海。上游逍遥村河道宽8米，下游盐滩至岛邓家河道宽35～40米。
九龙河（原名徐家河）
全长16.8公里，流域面积37平方公里。发源于西苑街道南葛拉村西北玉皇庙顶，流经南葛拉、竹园、闫家庄、范家埠、小天东、大天东、凤林，在齐鲁大道威东日综合食品有限公司西与蒿泊河交汇，向北在杨家滩入海。上游竹园河道宽8米，下游凤林河道宽35～40米。