1985年，全市法院受理再审案件1091件，审结1104件，再审改判案件567件，维持原判354件。1986年，根据党中央、国务院关于在中共十三大召开以前，基本完成审判工作方面落实政策任务的要求，全市法院系统组织141人的专门班子，对1958—1966年判处的历史反革命、现行反革命，破坏、阶级报复、违法乱纪案件；1958年以前判处的上述案件，本人、家庭提出申诉或有关单位、有关人员要求复查的案件；“文化大革命”中判处的刑事案件，经过复查又提出申诉或者漏复查的案件；未审结或新发现的落实统战政策的案件进行全面、细致的复查。全市复查案件5947件，占应复查总数的98.5%，其中维持原判的5662件，改判的259件。1988年，全市法院增设告诉申诉庭，改变过去审判监督案件由各审判业务庭自行审理的模式。至1990年，全市法院审结各类申诉案件3985件，其中刑事申诉占98%，民事经济申诉占2%。刑事申诉维持原判的50%，改判的40.3%；民事经济申诉案件维持原判的43.8%，改判的30%。
1993年，按照最高人民法院的要求，将告诉申诉工作从信访接待中解脱出来，逐步纳入审查立案、调处纠纷、接待信访、再审案件、督办督查的统管轨道，实现告诉统管。1997年，告诉申诉庭改为立案庭，各类诉讼、执行案件的立案工作统一由立案庭完成，审判庭不得再自立自审，实现立案权与审判权的分立。全市法院均设立审判监督庭，专司再审案件的审判工作，实现审判权与审判监督权的分立，形成立审、审执、审监三权分立，相互制衡的新型审判管理体制。2002年，全市法院受理再审案件350件，审结353件，改判69件，维持207件。