1985年，全市法院把“严打”斗争作为刑事审判的中心工作，开展严厉打击刑事犯罪活动。1987年，全市128个乡（镇、办事处）均设立人民法庭，达到省提出的“一乡一庭”的要求。1989年，市中级法院对涉及全市工商企业9亿元的债务纠纷进行依法清理。1990年，全市贯彻“稳定压倒一切”的方针，围绕保障和促进社会、经济发展，开展“反盗窃”、打击“车匪路霸”等专项斗争。1991年，全市法院组成为国营大中型企业服务的巡回法庭，帮助企业清理“三角债”。1992年，全市各基层法院均设立经济纠纷调解中心，开展诉讼外调解工作，对于事实清楚，当事人不愿提起诉讼的案件，采用非诉讼手段处理。
1994年，已生效民商事法律文书均由执行庭负责执行，审判庭不再担负案件的执行工作，实现执行权与审判权的分立。1996年，全市法院庭审方式进行改革，实行“一个公开，三个强化”（公开开庭审理案件，依法不公开审理的案件应当公开宣判；强化当事人举证责任、强化庭审功能、强化合议庭和独任审判员的作用）。1997年，市中级法院设立立案庭、审判监督庭，实现立审分立、审监分立，并成立赔偿委员会、财务装备处。1998年，按照《中华人民共和国法官法》的要求，对法官进行等级评定。1999年，全市法院完成人民法庭的改制工作，按照“三五个乡镇一个法庭”的要求，取消“一乡一庭”设置，将原来的128处法庭合并成为36处法庭。2000年，全市开始择优选任审判长和独任审判员，审判长主持合议庭庭审活动，由合议庭依照法定职责对案件进行裁判。2001年，全市法院进行“大立案”改革，实现立案、交费、排期、送达一次完成，并由立案庭对各类案件的审判流程和审理时限进行集中控制。2002年，市中级法院对民商事审判体制进行改革，取消专门的商事审判体制，设立“大民事”审判体制；取消原经济审判庭，设立民一、民二、民三、民四庭。县（市、区）法院均进行相应的“大民事”审判体制改革。