2000年，“三检合一”（进出境动植物检疫、国境卫生检疫、进出口商品检验）后新的检验检疫机制全面启动。由于无专业技术人员、实验室设备等，泰安检验检疫局从“两个有利于”出发，即有利于及早开展工作，有利于充分利用社会力量节约资金，积极构建新的工作模式。对于事业性质的国际旅行卫生保健业务，与市卫生防疫站合作开展。全年共检疫出入境人员494人次，其中外籍人员8人。查处乙肝表面抗原阳性5人。按照《山东检验检疫局卫生除害处理企业监督管理办法》，对42批出境木质包装及植物产品进行熏蒸处理。2001年，泰安检验检疫局完成房屋改造、装修、防护，安装和技术调试X光机等设备，建成国际旅行卫生保健中心，自主开展和体检和预防接种工作。检疫出入境人员1095人，其中外籍人员8人；监测体检发现病例19人，预防接种1297人。2002年，共检疫出入境人员传染病检测体检2159人次，实施预防接种2179人次。体检中发现病例91例。