1989年起，全市开展土地使用制度改革。至2002年，先后进行了宅基地、建设用地有偿使用、土地收购储备、地租征收、土地估价等土地使用制度改革工作。
一、宅基地有偿使用
1989年，在全市农村逐步试行农村宅基地有偿使用制度。规定在农村宅基地合法用地面积内，每年每平方米收取宅基地有偿使用费0.10～0.15元，超出合法面积部分，按上述收费标准的5倍以内分段累计收费。宅基地有偿使用费实行“村收、乡管、村用”的管理办法，全部用于村内基础设施和公益事业建设。至1990年，全市有3580个村实行宅基地有偿使用，占村总数的76.1%。其中，宁阳县625个行政村全部实行宅基地有偿使用，县内退出旧宅基地和村内空闲地520公顷，收取使用费383万元。全市共退出多占旧宅基地和村内空闲地1266.7公顷；收取宅基地有偿使用费1600万元，其中用于村公益事业建设1124万元。
1992年，宁阳县泗店乡率先对宅基地有偿使用制度进行改革，实行农村宅基地有偿有限期允许流动。全乡对172户3473.1平方米宅基地办理有偿有期限允许流动手续，年收入达25.61万元，增加集体收入1.26万元，向国家交税4万元。1994年，宅基地有偿使用费取消。
2001年，市政府根据新的中华人民共和国土地管理法村民住宅有关规定，重新修订农村村民住宅建设用地标准。对多余的宅基地不能收回处理的，或原有宅基地面积超过规定标准的，村民委员会可以实行有偿使用，收取有偿使用费。至2002年，全市70%的行政村实现宅基地有偿使用。
二、建设用地有偿使用
1991年，全市推行城镇国有土地使用权出让、转让和乡镇企业、景区服务设施用地有偿使用制度，并确定在新泰市、肥城县进行乡镇企业用地有偿使用试点，征收乡镇企业用地有偿使用费。乡镇企业用地有偿使用的范围包括乡（镇）村集体、联合体、个体用地从事各种经营性活动者。使用国有土地和集体土地的单位和个人（已交纳城镇土地使用税的除外），每年按实际占地面积每平方米收取使用费0.2～0.3元。该费主要用于乡镇公益事业建设和土地开发复垦。全市有68个乡镇实行乡镇企业用地有偿使用，占乡镇总数的49.3%，共收取使用费109.11万元；乡镇集体建设实际用地131公顷，节约用地计划指标101公顷。
1992年，全市建设用地有偿使用制度改革全面铺开，推行城镇国有土地使用权出让、转让。土地无偿、无限期使用改为有偿、有限期使用。宁阳县在磁窑镇公开拍卖4宗国有土地使用权，总面积4950平方米，成交价35.88万元，敲响全省土地拍卖第一锣。1994年，全市除党政机关办公用地及公共公益事业等用地外，均推行以出让方式供应土地的新制度。对乡镇集体建设用地和小城镇建设用地，试行先征为国有，然后办理出让手续的方法。年内审批各类建设用地2761宗，其中出让国有土地使用权150宗，办理集体建设用地出让手续212宗。1995年，市内出让国有土地使用权110余宗，为各级政府增加土地收益600余万元。
1996—1998年，市内除国家规定允许划拨的用地项目外，均采取出让、租赁的供地方式。全市国家建设用地为1364宗，其中办理出让330宗，租赁11宗，占国家建设用地总量的25%；原行政划拨土地使用权发生转让、出租、抵押或转入经营的450宗，全部办理了出让或租赁手续。同时开展土地使用权招标、拍卖试点，市内共拍卖土地使用权4宗，面积0.49公顷，招标出让2宗，面积0.48公顷。集体非农业建设用地总量4056宗，其中按政策规定实行“征为国有、统一出让”715宗，占应出让总数的80%。1999年1月，实施新的土地管理法，全市土地利用计划和用地预审管理力度加大，共审查用地100余宗，受理75宗，面积453.47公顷，均办理了农地转用和计划批复；审批各类建设项目用地71宗，面积442公顷。
2001年2月，市委、市政府召开全面推进土地使用制度改革工作会议，就土地有偿使用、集体非农业建设用地流转管理、城镇建设用地管理等进行部署。市国土资源市场建立，营业面积1500余平方米。市国土资源局对市华鲁机械有限公司3.35公顷土地成功进行招标，中标价5030万元，超出标的额1100万元；新泰市拍卖国有土地16宗，面积1.44公顷，增加政府收益220万元；宁阳县拍卖土地1宗，面积0.56公顷，成交价176万元；东平县招标国有土地使用权33宗，面积3.5公顷，成交价达到每平方米906元。2002年，全市共审核建设用地报件215宗，审批各类非农业建设用地402.63公顷；收取新增建设用地有偿使用费4337.34万元，征地管理费313.7万元；实现政府土地收益4.6亿元，超出计划任务0.8亿元。对经营性用地特别是房地产开发用地实行招标拍卖挂牌方式供地，全市招标拍卖挂牌出让土地使用权93宗，面积199.9公顷，实现政府土地纯收益1.69亿元。按照“明晰产权、强化资产、区分类型、灵活处置”的原则，依法处置泰安制药厂、泰安试验设备厂等遗留问题，收取国有土地使用权出让金3100余万元。
三、土地收购储备
2000年6月，市土地资产管理委员会成立；7月，市土地收购储备中心成立，负责泰城规划区内土地的收购、储备、出让前期准备等工作。该中心控制储备土地1033.33公顷。2001年，泰城规划区内筹措土地储备资金1.545亿元，控制储备土地1033.33公顷，收购储备土地80公顷，出让土地14公顷，实现政府土地收益1.2亿元。2002年，县（市、区）均成立土地收购储备中心。按照规划引导、超前储备、总量控制的方法开展土地收购储备，使之纳入负债经营、滚动发展、良性循环的运作轨道。全市共收购储备土地327.23公顷，出让96.09公顷，其中市级收购储备土地192.2公顷，出让65.53公顷，实现政府土地纯收益2.4亿元。
四、地租征收
2000年10月，市政府印发《地租征收暂行办法》，并成立市地租征收处，主要负责泰城规划区内国有、集体划拨土地的有偿使用和租赁使用费的征收工作，会同有关部门查处地租征收中违法违规行为。2001年，泰城规划区内征收地租178.44万元，向财政局提报机关事业单位地租抵扣申请33个，金额55万多元。新泰市征收地租280万元。宁阳县征收地租243万元。
2002年12月，新泰、肥城、宁阳、东平等四个县市成立地租征收处。市地租征收处调查确认泰城规划区缴纳地租宗地438宗，面积285.16公顷，金额663.29万元，实际征收地租272.03万元，比2001年增长65%。地租征收在区属以上企事业单位为主的基础上，扩大到街道办事处、村街居委会企业国有划拨土地的有偿使用，先后调查确认国有划拨用地154宗，面积95公顷，纳租金额192.7万元，实收地租10万元。
五、土地评估
1991年，市土地管理局和泰山区土地管理局对泰城城区土地进行定级评估试点工作，采用因素加权分值法、级差收益测算及租金剥离法等技术方法，将城区土地分成五个级别，依据各级土地基准地价，整理成一套完整的用地地价评估修正因素和修正系数等成果资料，该成果获省土地管理局科技成果一等奖。1992年，有四个县先后完成城区土地定级评估。
1993年，市地产咨询中心成立，负责地价评估和有关地价的管理工作。1994年，各县（市、区）均建立地产咨询评估机构。市内土地管理系统共有国家级土地评估师18人，评估土地69宗，评估金额达4.5亿元。1995年8月，市地产咨询中心更名市地产咨询评估事务所，增挂市地产咨询评估中心牌子，单位性质、人员编制不变。1996—1998年9月，全市有71个建制镇驻地的土地定级评估工作全面完成，评估土地516宗，评估金额近60亿元，10月，通过省验收。在完成土地定级评估的基础上，泰山区开展农用土地定级试点工作，并通过省级验收。1999年3月，泰城城区土地级别和基准地价调整工作被省土地管理局列为全省试点。年底，调整工作完成并获省土地管理局科技成果一等奖。2000年，各县（市、区）土地级别和基准地价调整工作全面完成。全市共评估土地564宗，评估总价值近8亿元，实现评估收入193万元。2001年，市国土资源局评估土地61宗，面积141.43公顷，评估总地价3.43亿元。
2002年12月，原市地产咨询评估中心（市地产咨询评估事务所）撤销。市土地评估中心成立。主要负责政府公益性、职能性、社会服务性的土地评估和政府有关地价管理的技术协调工作；基准地价、标定地价、出让底价的评估以及基准地价和标定地价查询服务工作等。市国土资源局评估土地180宗，评估总地价近3亿元。