一、管理体制改革
1987年，随着国有商业企业开始第一轮承包，市商业局陆续将经营、计划、工资、物价、人事、财务、奖励等权力下放给企业，企业开始自主经营、自负盈亏。市商业局由直接管理向间接管理转变，企业自主经营权扩大。
1991年4月，市财政贸易工作办公室（简称市财办）成立。主要职能是监督实施财贸事业发展规划和年度计划；收集分析财政、金融、贸易等部门的工作信息，为政府提供决策依据，沟通财贸各部门的横向联系；组织财贸单位开展“文明经营、优质服务”和搞好企业管理工作等。1992年12月，以商业局机关及所属事业单位为基础，组建市商业集团总公司，接受市财办指导，对县（市、区）商业集团总公司实施业务指导。直属企业有泰安市五金交电化工集团总公司、泰安百货采购供应站、泰安糖茶酒类采购供应站、泰安市食品公司、泰安市蔬菜公司、泰安百货大楼、齐鲁商业大厦、泰山饭店、市肉联厂等。1997年10月，市商会成立，市商业集团总公司总经理任会长。
2001年1月，市商业集团总公司撤销，市属部分国有商业企业由市商贸国资公司管理。市商贸国资公司根据企业上年度经营指标完成情况，围绕国有资产保值增值，确定对权属企业进行指标考核，企业法定代表人按委托经营资产数缴纳风险金，签订目标责任书，经营者收入与企业效益挂钩。2002年1月，市行业资产管理中心成立，管理市直部分国有商业企业。同年，市财办撤销，商贸流通经济运行的宏观调控职能移交市经贸委。
二、经营体制改革
1985年，市内商业流通体制由计划供应经营模式转向市场开放经营模式，商业贸易部门大力发展横向经济，增设批发网点和零售网点。
1986年，商业批发体制改过去固定对象、固定地区、固定价格为开放式批发体制。市属6个国有食品公司全部实行厂、司合一；60%的小型企业实行改、转、租；少数企业实行股份制。1987年，国有商业企业开始第一轮承包。市商业系统直属中小型企业74家，实行承包的65家，占87.4%；租赁的6家，占8.11%。1990年，市直属承包企业应完成利润4774.8万元，实际完成5007.1万元，占承包计划的104.9%；承包上缴利润1652.45万元；承包税前还贷1607.5万元，实际完成1987.89万元，占承包计划的123.7%；固定资产比承包前增加6061.8万元；销售总额34.29亿元，比承包前增长42.76%；工业品实行统购统销、计划收购、定购、选购、代销、厂家自销；农副产品实行合同定购、派购、议购、议销；粮食实行合同定购，定购价由统购价和超购价改为“倒三七”比例计价。1991年，市政府在流通领域实施“七一六”（即组建7个企业集团，建设10处专业批发市场、60处骨干商业网点）工程。年末，7个企业集团有4个正式组建运营，10处专业批发市场交付使用，60处骨干网点全面开工，其中46处建成运营；泰安百货大楼在全市率先实行“四放开”改革试点，当年完成销售额3782万元，实现利税372.1万元，职工年平均收入4100元。
1993年起，全市商业系统全面推行租赁、拍卖、破产、股份合作、国有民营等形式的改革，国有商业逐步改组改制，出现多元化格局；个体私营商业和集贸市场开始迅速发展，并成为市内商业系统的主体。全市67家流通企业推行股份制改造，其中10家正式组建为股份制企业，10家募股，25家完成资产评估、产权界定。流通企业股份制改造共募集股金1132万元。泰安百货大楼股票在二级市场挂牌交易；小型商业网点中有871个进行以租赁经营为主要形式的“国有民营”改革，占全部门店的55%；抽回流动资金1572万元，收回租金455万元。378个国有网点实行国有民营，占网点总数的88%。1996年，国有商业系统推行资产经营目标责任制，70家企业实现国有资产保值增值；14家企业实行兼并联合，安置职工1163人，盘活资产1029万元；6家企业实施依法破产，落实债权债务9290万元，安置职工1400人；537个门店实施租赁经营，收缴租金651万元；组建9家股份制企业，筹集资金3.93亿元。国有商业企业普遍实行全员劳动合同制、干部聘任制、岗位技能工资制并进行经理（厂长）年薪制试点。1997年，全市组建规范化商贸股份制企业11家，募集股本3.62亿元。其中，国有股1.13亿元，集体（法人）股4157万元，个人股2.08亿元。有24家企业被兼并，29家企业依法破产，537个门店实行租赁经营，352个门店实行国有民营。1998年，全市318家中小流通企业进行不同形式的改制。其中，组建企业集团9家，股份有限公司7家，有限责任公司45家，股份合作企业57家，国有民营42家，其他形式158家，改制面达98%。市糖茶站、百货站、五交化集团、商业广告公司等单位干部职工分别发起成立3家有限责任公司和4个股份合作制企业。泰安百货大楼对东岳商城实行租赁经营，国贸中心、糖茶站等企业对40余个经营网点实行抽本经营或承包租赁经营，市直商业企业改制面达70%。1999年，泰山饭店改制为49名股东入股72万元的安康餐饮有限公司，并实行承包经营；泰安百货大楼组建泰城最大的家电商场——三源家电公司，安排就业职工400人。2000年，市五金交电化工集团依法实施破产，消化企业历史债务9500万元，保全资产2600万元。2001年，市国有资产管理委员会授权商贸国资公司管理企业19家，授权资产9.5亿元，负债6.28亿元。全系统共有职工4423人。商贸国资公司对权属企业进行改制。除医药系统外，全市72家国有商业企业中国有控股的2家，国有资产全部退出的5家，分离经营的2家，破产2家，其他61家。
2002年，市商贸国资公司权属企业31家，分布在商业、物资、外经贸、医药、轻纺5个行业，其中改制为民营企业的8家，破产3家；公司总资产9.9亿元，总负债6.9亿元，净资产3亿元，职工4656人。全市国有商贸企业改革的重点转向推行现代企业制度，进一步规范改制公司运作、完善企业法人治理结构、明确“股东大会、董事会、监事会和管理层”职责，逐步建立相互制衡的经营机制。