一、两栖类
徂徕山两栖类动物共记1目（无尾目Anura）、3科、7种，占全省两栖类动物种数（9种）的77.78％，其中蛙科4种、蟾蜍科2种，姬蛙科1种。主要分布在河流、湖泊和水库周围岸边林内、田间、草丛和浅水中。徂徕山优势种为黑斑蛙，普通种为金线蛙、泽蛙和中华大蟾蜍。两栖类动物以捕食昆虫为主，蛙和蟾蜍都是农林害虫的天敌，且具有较高的药用价值，是重要的实验动物。黑斑蛙、金线蛙为山东省重点保护动物。
中华大蟾蜍 Bufo bufo gargarizans Cantor 又名大蟾蜍、蟾蜍、癞疙疱、癞蛤蟆、癞肚子。无尾目、蟾蜍科。体粗壮，体长10厘米以上，雄性较小，皮肤粗糙，全身布满大小不等的圆形瘰疣。头宽大，口阔，吻端圆，吻棱显著。舌分叉，可随时翻出嘴外，自如地把食物卷入口中。舌面含有大量粘液。近吻端有小形鼻孔1对。眼大而突出，对活动着的物体较敏感，对静止的物体迟钝。眼后方有圆形鼓膜，头顶部两侧有大而长的耳后腺1个。躯体粗而宽，四肢粗壮，前肢短、后肢长，趾端无蹼，步行缓慢。雄蟾前肢内侧3指（趾）有黑色婚垫，无声囊。口内无锄骨齿，上下颌亦无齿。近吻端有小形鼻孔1对。眼大而凸出，后方有圆形的鼓膜。头顶部两侧各有大而长的耳后腺。前肢长而粗壮，指趾略扁，指侧微有缘膜而无蹼，指关节下瘤多成对，掌突2个，外侧者大。后肢粗壮而短，胫跗关节前达肩部，趾侧有缘膜，蹼尚发达，内跖突形长而大，外跖突小而圆。体长79～120毫米。喜湿、暗、暖。白天栖息于河边、草丛、砖石孔等阴暗潮湿的地方，傍晚到清晨常在塘边、沟沿、河岸、田边、菜园、路旁或房屋周围觅食，夜间和雨后最为活跃，主要以蜗牛、蛞蝓、蚂蚁、蚊子、孑孓、蝗虫、土蚕、金龟子、蝼蛄、蝇及多种有趋光性的蛾蝶为食。气温下降到10℃以下，钻入砖石洞、土穴中或潜入水底冬眠。其味辛、性凉、有毒，具有解毒散结、消积利水、杀虫消疳的功效。现代医学证明蟾蜍还有局麻、强心、升压、抗肿瘤等作用。
金线蛙 Rana plancyi Lataste 无尾目、蛙科。体长50毫米（雄体略小），头略扁，吻钝圆，吻棱不显，鼓膜大而明显。指端尖圆，后肢粗短，趾端尖圆，趾间全蹼。背面及体侧的皮肤有分散的疣，背侧有一对背侧褶。腹面光滑，肛部及股后端有疣。生活时背面绿色或橄榄绿色，后肢背面棕色横纹不显，腹面黄白色。雄性有一对咽侧声囊，第一指有婚垫，有雄性腺。金线蛙成蛙以捕食昆虫为主，喜食种类主要是水中的螺、虾等。生活于山区的池塘、湖沼、鱼塘、荷花池等水生植物较多的自然水体内。
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二、爬行类
徂徕山爬行类动物共记3目、4科、9种，占全省爬行类动物种数（27种）的33.33％。其中，龟鳖目1科、1种，蜥蜴目2科、3种，蛇目1科、5种。主要分布在水库、河流和湖泊周围的林内、田间、草丛中，有的也分布在浅水中。徂徕山优势种为丽斑麻蜥、黄脊游蛇等。王锦蛇为山东省新记录。爬行类动物中，蛇类主要捕食鼠类，蜥蜴类则以昆虫为食，所食昆虫大多为农林害虫。爬行类动物大都可以入药，为传统的中药材。
山地麻蜥 Eremias brenchleyi Guenther
体长60毫米左右，尾长约90毫米。四肢发达，行动灵活。体侧为铁锈色或土黄色，背部棕绿色。以昆虫为食，多白天活动。山地丘陵区多见，在土穴或石缝中栖息，春夏季早晨气温升高后开始活动，中午气温高时更为活跃，冬季蛰伏于洞内，春季产卵繁殖。是徂徕山农林业的重要害虫天敌。3～7月为繁殖期，其中4～5月为交配产卵盛期。雌雄性比为1∶1.6。从交配到产卵为26天。卵白色、革质、椭圆形，长径平均为1.37（1.23～1.53）厘米，短径平均为0.86（0.7～1.06）厘米，卵重平均为0.6（0.4～0.85）克。每窝平均产卵4.1（3～5）枚，孵化期为50天，初孵出的小麻蜥尾端为蓝绿色，有金属光泽，1个月后逐步消失。个体自然寿命5.5～6周年。主要栖息在徂徕山海拔大于100米的山丘上部及山顶。山地麻蜥正常密度约为1只/100平方米，其数量与山丘土石状况、植被盖度及海拔高度有一定关系，与植被类型关系不大。山地麻蜥有一定的“护洞”行为，主食昆虫和蜘蛛，春季食物生态位宽度大于秋季，食物生态位重叠度0.61。该物种被国家林业局列入《国家保护的有益的或者有重要经济、科学研究价值的陆生野生动物名录》。