龙山书院，位于东平镇龙山之阳。东经116°31′，北纬35°54′。龙山，为东平古八景之一。这里有龙山圣井、十里杏花、幽深奇邃的窟洞，以及古老别致的古建筑群。古人有诗赞曰：“有史以来不记年，万代第一是龙山。诸君舍弃皇宫院，却奔深山住茅庵。龙山圣井甘泉水，天王殿侧建书院。藤萝乌柏遮天日，松柏长青伴春天。”如此优雅的环境，的确是读书讲学的好地方。龙山书院历经元、明、清三代，可谓桃李满天下、人才遍域中。现院址遗迹仍清晰可见。
至元三十年（1293），东平在州城东四十里的龙山设书院，名为东平龙山书院。东平龙山书院曾进行过两次移建：一是清乾隆二十五年（1760），龙山书院遭火灾，遂在州城内北门里路西重建龙山书院；二是清道光二十六年（1846），东平遭水灾，书院受损，全州绅民捐资，将书院移建于小东门里（现东平一中校址）。新建成的书院，规模宏敞，设置有讲堂、斋室、伙房、宿舍、办公房、藏书阁等房舍百余间。清光绪二年（1876），又在书院东侧新建试院（亦称考棚）、堂室、号舍等五十余间，为童试（考秀才）场所。
东平龙山书院由州训导署领导，设书院董事会。董事会成员由本州德高望重的知识分子组成，公推书院负责人一人，元、明两代称山长，清代称院长。书院章程规定：“书院为作育人才之所，而山（院）长即为人才模范。书院山（院）长由地方官绅自行延访品学兼优之人充任，无论何人不得徇情压荐。如山（院）长不实心教诲，即当辞谢，另请名师，一切情面嘱托亦不允从。”书院教师由山（院）长延请当地学行素著之员生、举人、进士充任。下设监学一人，负责生员管理；首士一人，负责办理生员生活事务；学长一人（在众生员中选举产生），负责办理生徒有关学习事宜。
书院不仅有朝廷颁发的《书院章程》，还有自已的院规。清咸丰九年（1859），进士蒋作锦（州城西南大渔营人）撰写东平龙山书院条规16条，规定了院长、主讲、教习授课和生徒学习、生活制度及奖惩条例，以及书院经费管理和使用范围、手续等。各项规章制度的要求都非常严格。如关于生徒学习、考试及生活方面的规定：“诸生必须服从院规。对违犯院规、不敬师长、荒废学业者，进行严格管教，乃至鞭笞和除名。”“诸生住院，饮酒、赌博者，查出重责不怠，院中并禁闲人游戏。”
对书院教习亦有明确规定：“为人师表，言行一致，处处做诸生模范。在教学上，要因材施教，循循善诱，以‘学而不厌，诲人不倦’夫子之言为左右铭。”
书院经费，主要来源于书院学田收入。
东平龙山书院一向颇有名气。元代“世称三王”的文学家王构、王旭和曾任东平学正的王磐，都曾担任过龙山书院的主讲；元代农学家王祯谢职旌德县尹归里后，于元仁宗延祐年间（1314—1320），曾在龙山书院主讲其农业科学名著《农书》。据传元代戏曲家、时人称为“小汉卿”的东平人高文秀，青年时代亦曾在龙山书院读书、习曲。
明、清两代，书院亦人才辈出。明进士、官至兵部尚书、东平人王宪及其子王汝孝都曾在龙山书院读过书。王汝孝，嘉靖五年进士，官至礼部郎中改翰林修撰。他遵父嘱，在龙山书院修碑撰文，感谢母校培育。碑文曰：“清河泱泱，龙山苍苍。桃李天下，母校永光。”仅清道光年间（1821—1850），东平就考中了王圣来等3名进士、李树朴等12名举人、孟衍观等31名贡生。
东平龙山书院的声誉曾一度影响至省外学者。据龙山大殿东深沟上的悬石刻文记载：解缙，江西吉水人，明代洪武年间进士，授中书庶吉士。被罢官后，曾游学到过龙山书院，并在龙山的一块悬石上读过书。后人在那块悬石上刻诗：“学士被罢官，游学至龙山。钻过药王洞，住过太子殿。曾饮圣井水，悬石为书案。成祖永乐初，又任翰林院。”
清代光绪三十年（1904），废科举兴学堂，将龙山书院改为东平第一高等小学堂。至此，东平龙山书院历经元、明、清三代，计600余年，对东平文化教育的发展产生了重大影响。