1991年，组织市直机关学党史、学党建“双学”活动，抓好社教工作，举办13场大型辅导报告会，将党群、综合系统全员轮训一遍。对机关党员进行反和平演变教育，举办市直机关县处级干部“七一”讲话学习班，组织600多名领导干部脱产学习。1992—1993年，开展市直机关以经济建设为中心思想大讨论，举办市直科级以上干部学习中共十四大精神报告会。组织市直机关解放思想换脑筋大讨论活动、学习新党章做新形势下合格共产党员活动。开展讲解放思想、讲坚持原则、讲团结奋斗、讲顾全大局、讲作风纪律、讲多作贡献“六大讲”活动。制定《市直机关学习〈邓小平文选〉第三卷意见》，举办“纪念毛泽东同志诞辰一百周年”大型图片展览，市直机关和各界群众2万多人参观。1994年，开展市直机关发展社会主义市场经济大讨论活动，举办社会主义市场经济知识“金贵杯”有奖竞赛、“三孔杯”有奖电视竞赛，举办4期党员领导干部学中共十四届四中全会《决定》报告会。1995—1998年，组织市直机关开展建设有中国特色社会主义理论和党章学习，举办学习贯彻中共十四届五中全会精神报告会、领导干部学《纲要》读书班和党支部书记学《纲要》读书班。召开向孔繁森学习动员会，举办事迹报告会，开展好公仆评选活动。组织开展“双学”活动、“树公仆形象，建九五业绩”活动、“一名党员一面旗”活动和“讲政治、学广泉、强素质、上水平”活动，组织学习贯彻中共十四届六中全会精神。举办市直机关党支部书记读书会，读书会情况被上报到中央办公厅。组织市直机关“学理论、学党章”“讲学习、讲政治、讲正气”活动，开展“抓住机遇，加快发展”大讨论活动，举办3期科级干部培训班，1100名党务干部参加学习。学习邓小平理论和中共十五大精神；开展“抓住机遇加快发展大讨论”和“创建文明机关、当好人民公仆”活动。举办市直机关党务干部读书会。1999年，在市直机关开展“三讲”教育，抓好市直部门专题学习，下发《关于在全市年轻干部中开展读书活动的意见》。组织市直机关党组织和党员干部同邪教组织进行坚决斗争，认真做好练习者的思想转化工作。
2000—2003年，组织市直机关认真学习“三个代表”重要思想、中共十六大精神和江泽民“5·31”讲话。各单位举办培训班200多期，报告会400多场次，发放中共十六届三中全会《决定》辅导读本和《完善社会主义市场经济体制十二讲》等学习材料。印发《大讨论学习材料》，召开调度会7次，编发大讨论专刊50期。2004年，举办学习“三个代表”重要思想和科学发展观培训班；组织市直和各县（市、区）机关党员干部参加科学发展观知识竞赛；开展创建“文明机关”活动；成立济宁市机关党建研究会。2005年，组织市直机关党员分两批参加先进性教育活动；参与第一批教育活动的督导工作，直接组织领导30个单位参加第二批教育活动。在全省机关工委经验交流会上作典型发言。在国家机关工委征文活动中获得理论成果三等奖。2006年，“三学三创”教育活动逐步深入。组织党员干部学习“三个代表”和胡锦涛一系列重要论述。征求群众意见建议8410条，归纳为4大类1378个问题。“三学三创”活动被省直工委评为“理论学习成果一等奖”，在全省会议上作典型发言。2007年，印发学习中共十七大《意见》，举办全市机关党务干部培训班。组织“创建高绩效机关”活动，在全市深化“三学三创”优化发展环境大会上作表态发言，在梁山县召开全市机关党建研讨会。2008年，组织深入学习中共十七届三中全会精神，开展“解放思想、改革创新、跨越发展”大讨论活动。深化“三学三创”开展“作风建设年”活动，开展“学苏北精神，促济宁跨越”活动，在泗水县召开全市机关党建研讨会，机关工委发挥机关党组织作用的探索与实践被评为“全省机关党建工作创新奖”，“学苏北精神、促济宁跨越”的做法被评为全省理论学习成果二等奖。被省直机关工委授予“机关党建宣传报道先进单位”称号，被省文明委授予“省级文明机关”称号。2009年，开展“跨越发展转变作风，机关先行、党员先行、干部先行”主题实践活动，在市人事局召开现场经验交流会。开展“六个一”读书活动。举办入党积极分子培训班、党务干部培训班、“三个先行”经验交流会等。2010年，开展“争当服务先锋”活动，组织“看变化、鼓干劲、强服务、促跨越”观摩。深入开展“创学习型机关、建学习型党组织、做学习型党员”活动，开办“圣地讲坛”“领导讲坛”“党员讲坛”，举办“学习点亮人生”演讲比赛总决赛、干部选拔任用“四项制度”知识竞赛。