1991年，市委宣传部设办公室、干部科、调研科、党员教育科、理论教育科、新闻科、宣传科、文教科、企政科、文明办。1992年，市委讲师团由隶属于市委宣传部领导改为隶属于市委领导。1994年，增设济宁市委对外宣传办公室、济宁市人民政府新闻办公室，实行一个机构、两块牌子，为副县级事业单位，挂靠市委宣传部。1995年，市对外宣传办公室（市政府新闻办公室）内设秘书科、宣传科，为副科级机构。2001年，根据山东省委批准的《中共济宁市委机构改革方案》《中共济宁市委机构改革实施意见》，市委宣传部设办公室、干部科、调研科、宣传教育科、新闻出版科、文艺科、理论与党员教育科、企业宣传科等8个职能科室和市精神文明建设委员会办公室、济宁市委对外宣传办公室（挂济宁市人民政府新闻办公室牌子）。2003年，设立济宁市网络新闻宣传管理中心，为科级全额预算管理事业单位，由市委对外宣传办公室（市政府新闻办公室）管理。2005年12月，设立济宁市互联网信息研究中心，为副县级全额预算管理事业单位，加挂济宁市互联网管理办公室牌子，隶属市委宣传部领导，同时将原隶属于市委对外宣传办公室（市政府新闻办公室）的济宁市网络新闻宣传管理中心撤销。2006年，济宁市互联网信息研究中心内设综合管理科、舆情信息科。2008年，市精神文明建设委员会办公室在原有综合调研科、活动协调科的基础上，增设未成年人思想道德建设工作科。2009年，根据省委、省政府《关于推动文化大发展大繁荣的意见》，市委宣传部增设文化体制改革和文化产业发展科。